Cluster computing 让SGE jobid制作管道_Cluster Computing_Pipeline_Sungridengine

Cluster computing 让SGE jobid制作管道

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Cluster computing 让SGE jobid制作管道,cluster-computing,pipeline,sungridengine,Cluster Computing,Pipeline,Sungridengine,假设我想编写一个任务管道，提交给Sun/Oracle网格引擎 qsub -cwd touch a.txt qsub -cwd -hold_jid touch wc -l a.txt 现在，只有在第一个作业（触摸）完成后，才会运行第二个作业（wc）。但是，如果名称为touch的前一个作业已在较早时运行，则第二个作业将不会保留，因为条件已满足。我需要第一份工作的jobid 我试过了 myjid=`qsub -cwd touch a.txt` 但是它给了$echo$myjid 您的作业106248

假设我想编写一个任务管道，提交给Sun/Oracle网格引擎

qsub -cwd touch a.txt
qsub -cwd -hold_jid touch wc -l a.txt

现在，只有在第一个作业（触摸）完成后，才会运行第二个作业（wc）。但是，如果名称为touch的前一个作业已在较早时运行，则第二个作业将不会保留，因为条件已满足。我需要第一份工作的jobid

我试过了

myjid=`qsub -cwd touch a.txt`

但是它给了

$echo$myjid
您的作业1062487（“touch”）已提交

您只需将

-terse

选项添加到第一个

qsub

中，以便它只显示作业ID，而不是整个字符串

JID=`qsub -terse -cwd touch a.txt`