Fortran 我是否误用了mpi文件？
我有一段代码，用MPI-IO在文件中写入数据。当我使用Fortran 我是否误用了mpi文件？,fortran,mpi,openmpi,mpi-io,Fortran,Mpi,Openmpi,Mpi Io,我有一段代码，用MPI-IO在文件中写入数据。当我使用mpi\u file\u write时，它工作得很好，但是如果我切换到集合mpi\u file\u write\u all我会得到错误的结果。我是否需要更改对write函数的调用以使用集体写入例程 使用mpi\u file\u write文件包含预期结果，格式为“1 2 3 4”的4行 但是使用mpi\u file\u write\u all时，结果文件不同：数据顺序错误： $od -f TEST 0000000
mpi\u file\u writempi\u file\u write\u allmpi\u file\u writempi\u file\u write\u all$od -f TEST
0000000 1 1 2 3
0000020 2 4 3 4
0000040 1 2 1 3
0000060 2 3 4 4
0000100
mpi\u file\u writempi\u file\u write\u all PROGRAM INDEXED
USE MPI
IMPLICIT NONE
REAL :: A(4)
INTEGER :: INDEXTYPE,FH,IERR,L,N
INTEGER(KIND=MPI_OFFSET_KIND) :: OFFSET
CHARACTER(LEN=MPI_MAX_LIBRARY_VERSION_STRING) :: VERSION
N=4
A(1)=1.0
A(2)=2.0
A(3)=3.0
A(4)=4.0
CALL MPI_INIT(IERR)
CALL MPI_GET_LIBRARY_VERSION(VERSION,L,IERR)
WRITE(*,*)TRIM(VERSION)
CALL CREATE_TYPE(INDEXTYPE,N)
CALL MPI_FILE_OPEN(MPI_COMM_WORLD, "TEST",
& MPI_MODE_RDWR+MPI_MODE_CREATE, MPI_INFO_NULL,FH,IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
OFFSET=0
CALL MPI_FILE_SET_VIEW(FH, OFFSET,MPI_REAL,
& INDEXTYPE,'NATIVE',
& MPI_INFO_NULL, IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_FILE_WRITE(FH,A,N,MPI_REAL,
& MPI_STATUS_IGNORE,IERR)
!CALL MPI_FILE_WRITE_ALL(FH,A,N,MPI_REAL,
!& MPI_STATUS_IGNORE,IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_FILE_CLOSE(FH,IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_FINALIZE(IERR)
END PROGRAM INDEXED
SUBROUTINE CREATE_TYPE(DATARES_TYPE,N)
USE MPI
IMPLICIT NONE
INTEGER, INTENT(OUT) :: DATARES_TYPE
INTEGER, INTENT(IN) :: N
INTEGER :: IERR, MY_RANK
INTEGER, ALLOCATABLE :: BLOCKLENS(:), DISPLACEMENTS(:)
ALLOCATE(BLOCKLENS(N))
ALLOCATE(DISPLACEMENTS(N))
BLOCKLENS = 1
CALL MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD, MY_RANK, IERR)
IF(MY_RANK==0)THEN
DISPLACEMENTS(1)=0
DISPLACEMENTS(2)=5
DISPLACEMENTS(3)=2
DISPLACEMENTS(4)=3
ENDIF
IF(MY_RANK==1)THEN
DISPLACEMENTS(1)=4
DISPLACEMENTS(2)=1
DISPLACEMENTS(3)=6
DISPLACEMENTS(4)=7
ENDIF
IF(MY_RANK==2)THEN
DISPLACEMENTS(1)=8
DISPLACEMENTS(2)=9
DISPLACEMENTS(3)=14
DISPLACEMENTS(4)=11
ENDIF
IF(MY_RANK==3)THEN
DISPLACEMENTS(1)=12
DISPLACEMENTS(2)=13
DISPLACEMENTS(3)=10
DISPLACEMENTS(4)=15
ENDIF
CALL MPI_TYPE_INDEXED(N, BLOCKLENS, DISPLACEMENTS,
& MPI_REAL, DATARES_TYPE, IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_TYPE_COMMIT(DATARES_TYPE, IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
DEALLOCATE(BLOCKLENS)
DEALLOCATE(DISPLACEMENTS)
END SUBROUTINE
SUBROUTINE MPI_CHECK_CALL(IERR)
USE MPI
IMPLICIT NONE
INTEGER, INTENT(IN) :: IERR
INTEGER :: NERR, RESULTLEN
CHARACTER(LEN=MPI_MAX_ERROR_STRING) :: SERR
IF(IERR /= MPI_SUCCESS) THEN
CALL MPI_ERROR_STRING(IERR,SERR,RESULTLEN,NERR)
WRITE(*,*)SERR
CALL BACKTRACE
END IF
END SUBROUTINE
您确实没有正确使用
MPI\u文件\u设置\u视图（）。
来自标准（MPI 3.1，第13.3章）（感谢廖伟的指点）
etype（基本数据类型）是数据访问和存储的单位
定位它可以是任何MPI预定义或派生的数据类型。衍生
可以使用任何MPI数据类型构造函数来构造etype
例程，前提是所有生成的类型映射位移
非负的和单调的不减损的
您的派生数据类型不符合（至少）列组1
和3
FWIW
- 如果使用MPICH中的ROM-IO，程序将崩溃，我在上报告了该问题，并且ROM-IO应该返回一条错误消息
- 该程序在最新的OpenMPIv3.0.x（默认情况下使用ompio）下崩溃/挂起，但在v3.1.x和主分支上运行良好。请注意，正确的修复方法是修复代码，未来的开放MPI版本在不久的将来将出错
我假定您是以固定格式代码编写的。我不知道为什么您会选择对Fortran 90+代码执行此操作，因此，如果我弄错了，请回滚该编辑（并更正行的延续，等等）。您能否使用mpirun-mca io romio314…
？@GillesGouaillardet我使用您建议的选项尝试了此示例，它使示例崩溃，使用mpi\u file\u write
或mpi\u file\u write\u all
。消息抱怨“双重释放或损坏”，当调用mpi\u file\u write
（或mpi\u file\u write\u all`）时，回溯会定位崩溃。@francescalus好的，谢谢。我写这个小例子的风格与我修改我正在开发的软件时必须使用的风格相同，它使用fortran的新功能，但遗憾的是它有一个旧的ident风格。所以这个例子就是习惯的力量。好的，我来看看。非常感谢你的调查和你的时间！我要修正我的密码。
PROGRAM INDEXED
USE MPI
IMPLICIT NONE
REAL :: A(4)
INTEGER :: INDEXTYPE,FH,IERR,L,N
INTEGER(KIND=MPI_OFFSET_KIND) :: OFFSET
CHARACTER(LEN=MPI_MAX_LIBRARY_VERSION_STRING) :: VERSION
N=4
A(1)=1.0
A(2)=2.0
A(3)=3.0
A(4)=4.0
CALL MPI_INIT(IERR)
CALL MPI_GET_LIBRARY_VERSION(VERSION,L,IERR)
WRITE(*,*)TRIM(VERSION)
CALL CREATE_TYPE(INDEXTYPE,N)
CALL MPI_FILE_OPEN(MPI_COMM_WORLD, "TEST",
& MPI_MODE_RDWR+MPI_MODE_CREATE, MPI_INFO_NULL,FH,IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
OFFSET=0
CALL MPI_FILE_SET_VIEW(FH, OFFSET,MPI_REAL,
& INDEXTYPE,'NATIVE',
& MPI_INFO_NULL, IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_FILE_WRITE(FH,A,N,MPI_REAL,
& MPI_STATUS_IGNORE,IERR)
!CALL MPI_FILE_WRITE_ALL(FH,A,N,MPI_REAL,
!& MPI_STATUS_IGNORE,IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_FILE_CLOSE(FH,IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_FINALIZE(IERR)
END PROGRAM INDEXED
SUBROUTINE CREATE_TYPE(DATARES_TYPE,N)
USE MPI
IMPLICIT NONE
INTEGER, INTENT(OUT) :: DATARES_TYPE
INTEGER, INTENT(IN) :: N
INTEGER :: IERR, MY_RANK
INTEGER, ALLOCATABLE :: BLOCKLENS(:), DISPLACEMENTS(:)
ALLOCATE(BLOCKLENS(N))
ALLOCATE(DISPLACEMENTS(N))
BLOCKLENS = 1
CALL MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD, MY_RANK, IERR)
IF(MY_RANK==0)THEN
DISPLACEMENTS(1)=0
DISPLACEMENTS(2)=5
DISPLACEMENTS(3)=2
DISPLACEMENTS(4)=3
ENDIF
IF(MY_RANK==1)THEN
DISPLACEMENTS(1)=4
DISPLACEMENTS(2)=1
DISPLACEMENTS(3)=6
DISPLACEMENTS(4)=7
ENDIF
IF(MY_RANK==2)THEN
DISPLACEMENTS(1)=8
DISPLACEMENTS(2)=9
DISPLACEMENTS(3)=14
DISPLACEMENTS(4)=11
ENDIF
IF(MY_RANK==3)THEN
DISPLACEMENTS(1)=12
DISPLACEMENTS(2)=13
DISPLACEMENTS(3)=10
DISPLACEMENTS(4)=15
ENDIF
CALL MPI_TYPE_INDEXED(N, BLOCKLENS, DISPLACEMENTS,
& MPI_REAL, DATARES_TYPE, IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
CALL MPI_TYPE_COMMIT(DATARES_TYPE, IERR)
CALL MPI_CHECK_CALL(IERR)
DEALLOCATE(BLOCKLENS)
DEALLOCATE(DISPLACEMENTS)
END SUBROUTINE
SUBROUTINE MPI_CHECK_CALL(IERR)
USE MPI
IMPLICIT NONE
INTEGER, INTENT(IN) :: IERR
INTEGER :: NERR, RESULTLEN
CHARACTER(LEN=MPI_MAX_ERROR_STRING) :: SERR
IF(IERR /= MPI_SUCCESS) THEN
CALL MPI_ERROR_STRING(IERR,SERR,RESULTLEN,NERR)
WRITE(*,*)SERR
CALL BACKTRACE
END IF
END SUBROUTINE