Makefile 生成文件中的LSF作业数组

我正在运行一个LSF作业数组，以便在生成文件中创建一个目标。 但是，一旦提交数组，make就会考虑执行目标的命令，并抛出一个错误，因为目标不存在

如何强制make在移动到其他相关目标之前等待LSF作业阵列完成

例如：

all: final.txt

first_%.txt:
    bsub -J" "jarray[1-100]" < script.sh

final.txt: first_%.txt
    cat first_1.txt first_50.txt first_100.txt > final.txt

all:final.txt
第一个文本：
b sub-J“jarray[1-100]”final.txt

---

遗憾的是，作业数组不支持-K标志。

您需要请求

bsub

命令等待作业完成。我从未使用过它，但根据，您可以添加

-K

选项来完成此操作。

尝试

bsub-K

，这将强制bsub保持在前台，直到作业完成

编辑

由于该选项在阵列上不受支持，我认为您必须将阵列作为单独的作业提交，例如：

for i in `seq 1 100`; do 
            export INDEX=$i
            bsub -K < script.sh & 
done
wait

对于'seq 1100'中的i；do
出口指数=$i
bsub-K

---

您必须手动将索引传递给脚本，而不是使用作业数组索引。

bsub-K在作业数组上不起作用。“作业数组不支持-K选项。作业未提交。“啊哈，在这种情况下，你不会很喜欢我的另一个解决方案，我会添加，但这是我所能想到的…bsub-K在作业数组上不起作用。”作业数组不支持-K选项。作业未提交。“那太糟糕了。嗯，你必须找到一种方法，让你的食谱等到一切都完成了。这里没有任何

make

可以提供帮助：您需要通过食谱中的脚本或其他方式来解决这个问题。它需要是一个makefile吗？您可能会使用作业依赖项执行

cat…>作业中的final.txt

。或者，您可以保留makefile并使用

bsub-K

进行最后的作业。这样，final.txt的规则在完成之前仍将被阻止。