Parallel processing 令人尴尬的并行执行，无加速（MEEP、openMPI）
我一直在尝试利用并行化，以更快地使用MEEP仿真软件运行一些仿真。默认情况下，软件只使用一个CPU，FDTD模拟很容易通过并行化加速。最后，我发现运行1个或4个内核之间没有差异，模拟时间是相同的 然后我想我应该在每个核心上运行单独的模拟，以增加我的总模拟吞吐量（例如，同时运行4个不同的模拟） 我发现令人惊讶的是，每当我开始一个新的模拟时，已经开始的模拟都会变慢，即使它们运行在不同的内核上。例如，若我只在一个核心上运行一个模拟，FDTD模拟的每个时间步长大约需要0.01秒。如果我在另一个内核上启动另一个进程，每个模拟现在每个时间步花费0.02秒，以此类推，这意味着即使我在不同的内核上运行与彼此无关的不同模拟，它们都会减速，不会给我带来速度的净增长 我不一定是在寻求帮助来解决这个问题，而是在寻求帮助来理解它，因为它激发了我的好奇心。模拟的每个实例需要的内存不到我总内存的1%，所以这不是内存问题。我能想到的唯一一件事是共享高速缓存的内核，或者内存带宽饱和，有没有办法检查这种情况 模拟是相当简单的，我运行的程序比这个程序内存消耗大得多，并行化的速度大大加快Parallel processing 令人尴尬的并行执行，无加速（MEEP、openMPI）,parallel-processing,mpi,meep,Parallel Processing,Mpi,Meep,我一直在尝试利用并行化，以更快地使用MEEP仿真软件运行一些仿真。默认情况下，软件只使用一个CPU，FDTD模拟很容易通过并行化加速。最后，我发现运行1个或4个内核之间没有差异，模拟时间是相同的 然后我想我应该在每个核心上运行单独的模拟，以增加我的总模拟吞吐量（例如，同时运行4个不同的模拟） 我发现令人惊讶的是，每当我开始一个新的模拟时，已经开始的模拟都会变慢，即使它们运行在不同的内核上。例如，若我只在一个核心上运行一个模拟，FDTD模拟的每个时间步长大约需要0.01秒。如果我在另一个内核上启动
有什么提示可以帮助我理解这种现象吗？我认为最好在更大的模拟上看一下，因为类似turbo boost技术的众所周知的问题（单核性能随线程数的变化）无法解释您的结果。它将解释我们是否有一个单核处理器
所以，我认为这可以用内存缓存级别来解释。也许如果您尝试比L3缓存大得多的模拟（i7大于8MB）。我认为应该更好地考虑更大的模拟，因为类似turbo boost技术的众所周知的问题（单核性能随线程数的变化）无法解释您的结果。它将解释我们是否有一个单核处理器 所以，我认为这可以用内存缓存级别来解释。如果您尝试比L3缓存大得多的模拟（i7大于8MB）。我在英特尔（R）核心（TM）i7-3517U CPU@1.90GHz双核（4个线程）上的测试。1个mpi线程（-np 1）的所有模拟 10mb模拟：
- 四次模拟0.0255秒/步
- 两次模拟0.0145秒/步
- 一次模拟0.0129秒/步 100mb模拟：
- 四次模拟1.13秒/步
- 两次模拟0.61秒/步
- 一次模拟0.53秒/步
- 四次模拟0.0255秒/步
- 两次模拟0.0145秒/步
- 一次模拟0.0129秒/步 100mb模拟：
- 四次模拟1.13秒/步
- 两次模拟0.61秒/步
- 一次模拟0.53秒/步
奇怪的是，两个模拟（每个模拟有2个线程）的运行速度几乎与两个模拟（每个模拟有1个线程）的运行速度相同。您应该使用适当的工具读取硬件性能计数器，这些计数器可以指示共享资源为瓶颈。有很多。但是，如果你只是单独运行应用程序，你可以使用一些简单的方法，比如。你的分析是一个很好的开始，但是还有其他可能的问题：涡轮频率降低，超线程/AMD推土机“模块”，但是如果没有更具体的系统和应用程序信息，就不可能知道数据长度是多少？100MB？试着让所有核心只在1MB部件上工作，然后在完成后继续在另一个部件上工作。这样，当一个核心访问一个单元时，另一个核心可以作为另一个单元的邻居访问它。您可以使用
perfperf