在awk中使用sed

见下一行：

1   164184236   DEL00004514;DEL00004533 N   <DEL>   .   PASS    .   GT:GL:GQ:FT:RCL:RC:RCR:CN:DR:DV:RR:RV   .   .   .   .   0/1:-11.985,0,-35.4847:120:PASS:20:18:19:1:0:0:12:6 .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   0/1:-6.1941,0,-9.19766:62:PASS:4:3:2:1:0:0:3:3  .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   0/1:-9.19536,0,-11.6939:92:PASS:4:5:7:1:0:0:4:4 .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .   .

1164184236 DEL00004514；DEL00004533 N。通过。GT:GL:GQ:FT:RCL:RC:RCR:CN:DR:DV:RR:RV。0/1:-11.985,0，-35.4847:120:通过：20:18:19:1:0:0:12:6。0/1:-6.1941,0，-9.19766:62：通过：4:3:2:1:0:0:3:3。0/1:-9.19536,0，-11.6939:92：通过：4:5:7:1:0:0:4:4。

我的目的是：对于所有列，如果它是

，那么我想将其更改为

0/0

，那么我该怎么做呢？我正在考虑在awk中引入sed，例如：

awk'{if（$n=“.”）sed's/\./0\/0/g'}'

---

确切地说，我应该怎么做？

下面是我将使用的awk命令：

---

awk'{for（i=1；i以下是我将使用的awk命令：

awk'{for（i=1；i带sed），对于三个空格的列分隔符：

sed 's/\( \{3\}\)\./\10\/0/g' file

如果以制表符分隔：

sed 's/\t\./\t0\/0/g' file

输出：

1   164184236   DEL00004514;DEL00004533 N   <DEL>   0/0   PASS    0/0   GT:GL:GQ:FT:RCL:RC:RCR:CN:DR:DV:RR:RV   0/0   0/0   0/0   0/0   0/1:-11.985,0,-35.4847:120:PASS:20:18:19:1:0:0:12:6 .   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/1:-6.1941,0,-9.19766:62:PASS:4:3:2:1:0:0:3:3  .   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/1:-9.19536,0,-11.6939:92:PASS:4:5:7:1:0:0:4:4 .   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0

从找到的第二个
开始替换，假设前五列没有点值。
使用sed，对于三个空格的列分隔符：

sed 's/\( \{3\}\)\./\10\/0/g' file

如果以制表符分隔：

sed 's/\t\./\t0\/0/g' file

输出：

1   164184236   DEL00004514;DEL00004533 N   <DEL>   0/0   PASS    0/0   GT:GL:GQ:FT:RCL:RC:RCR:CN:DR:DV:RR:RV   0/0   0/0   0/0   0/0   0/1:-11.985,0,-35.4847:120:PASS:20:18:19:1:0:0:12:6 .   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/1:-6.1941,0,-9.19766:62:PASS:4:3:2:1:0:0:3:3  .   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/1:-9.19536,0,-11.6939:92:PASS:4:5:7:1:0:0:4:4 .   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0   0/0

从找到的第二个
开始替换，假设前五列没有点值。
sed仅用于在单个行上进行简单替换。此作业比注释中要求不更改第六个字段的要求稍微多一些，因此适合此作业的工具是awk：

$ awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {for (i=1;i<=NF;i++) if (($i==".") && (i!=6)) $i="0/0"} 1' file
1       164184236       DEL00004514;DEL00004533 N       <DEL>   .       PASS    0/0     GT:GL:GQ:FT:RCL:RC:RCR:CN:DR:DV:RR:RV   0/0   0/0      0/0     0/0     0/1:-11.985,0,-35.4847:120:PASS:20:18:19:1:0:0:12:6     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0   0/0      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1:-6.1941,0,-9.19766:62:PASS:4:3:2:1:0:0:3:3  0/0     0/0     0/0     0/0     0/0   0/0      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1:-9.19536,0,-11.6939:92:PASS:4:5:7:1:0:0:4:4 0/0     0/0   0/0      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0

$awk'BEGIN{FS=OFS=“\t”}{for（i=1；ised仅用于单个行上的简单替换，仅此而已。此作业比注释中要求不更改第6个字段的要求稍微多一些，因此适合此作业的工具是awk:

$ awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {for (i=1;i<=NF;i++) if (($i==".") && (i!=6)) $i="0/0"} 1' file
1       164184236       DEL00004514;DEL00004533 N       <DEL>   .       PASS    0/0     GT:GL:GQ:FT:RCL:RC:RCR:CN:DR:DV:RR:RV   0/0   0/0      0/0     0/0     0/1:-11.985,0,-35.4847:120:PASS:20:18:19:1:0:0:12:6     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0   0/0      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1:-6.1941,0,-9.19766:62:PASS:4:3:2:1:0:0:3:3  0/0     0/0     0/0     0/0     0/0   0/0      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1:-9.19536,0,-11.6939:92:PASS:4:5:7:1:0:0:4:4 0/0     0/0   0/0      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0

$awk'BEGIN{FS=OFS=“\t”}{for（i=1；iCool.Mine是制表符分隔的…。但实际上还有另一个问题：我必须将第6列保留为“.”，所以我尝试了awk'{$6=“.”“print}“，但是制表符丢失了
和
传递之间的
？更新了我的答案。酷。我的是制表符分隔的…但实际上还有另一个问题：我必须将第6列保留为”“。所以我尝试了awk'{$6=“.”“print}”，但是tab会丢失
和
PASS
之间的
？更新了我的答案。sed和awk是两个不同的工具，每个工具都可以从shell调用。你永远不会从awk调用sed，反之亦然。请阅读Arnold Robbins的《有效的awk编程》，第四版。sed和awk是两个不同的工具，每个工具都可以从shell调用。你永远不会从awk调用sed，反之亦然。请阅读Arnold Robbins的《有效的awk编程》，第四版。