Bash 删除特定字符| awk后的行

我正在写一个Bash脚本， 我需要删除TER之间的所有行，包括“TER”

输入文件：

ATOM    186  O3'   U     6       7.297   6.145  -5.250  1.00  0.00           O  
ATOM    187 HO3'   U     6       7.342   5.410  -5.865  1.00  0.00           H  
TER
ATOM      1 HO5'   A     1       3.429  -7.861   3.641  1.00  0.00           H  
ATOM      2  O5'   A     1       4.232  -7.360   3.480  1.00  0.00           O  
ATOM      3  C5'   A     1       5.480  -8.064   3.350  1.00  0.00           C  
ATOM      4  H5'   A     1       5.429  -8.766   2.518  1.00  0.00           H  
TER

预期产出：

ATOM    186  O3'   U     6       7.297   6.145  -5.250  1.00  0.00           O  
ATOM    187 HO3'   U     6       7.342   5.410  -5.865  1.00  0.00           H  

我发现

sed '/TER/,$d' ${myArray[j]}.txt >> ${MyArray[j]}.txt  ### ${MyArray[j]} file name through an array 

但这不起作用，我认为awk将与Bash脚本一起工作。帮助谢谢

您可以这样使用sed：

sed -i.bak '/^TER/,/^TER/d' "${myArray[j]}.txt"
cat "${myArray[j]}.txt"

---

可以这样做

sed '/TER/,$d' ${myArray[j]}.txt > tmp.txt #note only one " > "
mv tmp.txt ${myArray[j]}.txt

awk还提供了一个使用标志控制打印的简单解决方案。下面的skip变量用作标志。如果跳过1行，则在从1到0的转换过程中，脚本将退出

awk -v skip=0 '$1=="TER"{skip=skip?1:0; if (!skip)exit}1' file

高于$1==TER用于匹配第一个字段为TER的行记录，这消除了TER和TERMINAL之间的歧义，等等。。。在该规则中，三元skip=skip？1:0在第一次遇到TER时设置skip=1，在下一次遇到TER时设置skip=0。如果skip==0，则脚本退出。最后的1只是印刷品的简写

示例使用/输出

使用文件中的数据，您将获得：

$ awk -v skip=0 '$1=="TER"{skip=skip?1:0; if (!skip)exit}1' file
ATOM    186  O3'   U     6       7.297   6.145  -5.250  1.00  0.00           O
ATOM    187 HO3'   U     6       7.342   5.410  -5.865  1.00  0.00           H

---

您期望的输出是什么？相同的文件不更改附加到您正在读取的相同文件不是最好的主意。expeced output是前两行，三行之间没有行。。。。。。tersed脚本“/TER/，$d本身生成正确的输出，即使它也会删除第二个TER后面的行。但正如@Shawn所建议的，原始命令中的问题是另一个。最好锚定为sed'/^\s*TER$/，/^\s*TER$/d'，以要求TER作为第一个非空白字，并从终端消除歧义，等等。。

   echo 
   "ATOM    186  O3'   U     6       7.297   6.145  -5.250  1.00  0.00           O  
    ATOM    187 HO3'   U     6       7.342   5.410  -5.865  1.00  0.00           H  
    TER
    ATOM      1 HO5'   A     1       3.429  -7.861   3.641  1.00  0.00           H  
    ATOM      2  O5'   A     1       4.232  -7.360   3.480  1.00  0.00           O  
    ATOM      3  C5'   A     1       5.480  -8.064   3.350  1.00  0.00           C  
    ATOM      4  H5'   A     1       5.429  -8.766   2.518  1.00  0.00           H  
    TER"  |sed '/TER/,/TER/d' 


######################################################################################

ATOM    186  O3'   U     6       7.297   6.145  -5.250  1.00  0.00           O  
ATOM    187 HO3'   U     6       7.342   5.410  -5.865  1.00  0.00           H 

sed '/Start Pattern/,/End Pattern/d'

awk -v skip=0 '$1=="TER"{skip=skip?1:0; if (!skip)exit}1' file

$ awk -v skip=0 '$1=="TER"{skip=skip?1:0; if (!skip)exit}1' file
ATOM    186  O3'   U     6       7.297   6.145  -5.250  1.00  0.00           O
ATOM    187 HO3'   U     6       7.342   5.410  -5.865  1.00  0.00           H