Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/9/delphi/9.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Biopython 快速计数器输出_Biopython_Fastq - Fatal编程技术网

Biopython 快速计数器输出

Biopython 快速计数器输出,biopython,fastq,Biopython,Fastq,我使用的是FastQGeneraliator,但我发现它从fastq文件的第一行删除了@,也删除了第三行的信息(它删除了整个第三行)。 我用以下方式在第1行中添加了@: for line in open("prova_FiltraN_CE_filt.fastq"): fout.write(line.replace('SEQ', '@SEQ')) 我还想加上第三行,以+开头,后面什么也没有。例如: @SEQILMN0 TCATCGTA.... + #<BBB

我使用的是FastQGeneraliator,但我发现它从fastq文件的第一行删除了@,也删除了第三行的信息(它删除了整个第三行)。 我用以下方式在第1行中添加了@:

for line in open("prova_FiltraN_CE_filt.fastq"):
fout.write(line.replace('SEQ', '@SEQ'))
我还想加上第三行,以+开头,后面什么也没有。例如:

    @SEQILMN0
    TCATCGTA....
    +
    #<BBBFFF.....
@SEQILMN0
TCAGTA。。。。
+
# 你可以用

使用
FastqGeneralIterator

@SEQILMN0 TCATCGTA.... + #<BBBFFF.... @SEQILMN0 TCAGTA。。。。 +
#您能否显示完整的代码、输入文件示例和预期的输出? @SEQILMN0 TCATCGTA.... + #<BBBFFF....