File 识别AWK中的重叠范围

我有一个文件，有3行3列（制表符分隔），例如：

第二个文件有3列行（制表符分隔），例如：

如果两个文件中的$1都匹配，并且文件1中的$2到$3的范围与文件2中的$2到$3的范围完全不匹配，那么我需要一个与行匹配的awk命令。它可以在文件2中的值范围内，或者文件2中的范围可以在文件1中的范围内，或者只是部分重叠。范围之间的任何类型的相交都将被视为匹配，然后在文件3中打印该行

我当前的代码仅在$1和$2或$3匹配时匹配，但在这些情况下，精确的数字不匹配，因此不适用于范围在彼此范围内的情况

  awk '
        BEGIN {
            FS = "\t";
        }
        FILENAME == ARGV[1] {
            pair[ $1, $2, $3 ] = 1;
            next;
        }
        {
            if ( pair[ $1, $2, $3 ] == 1 ) {
                print $1 $2 $3;
            }
        }

输入示例：

文件1：

1 10 23
2 30 50
6 100 110
8 20 25

文件2：

1 5 15
10 30 50
2 10 100
8 22 24

这里第1行（file1）与第1行（file2）匹配，因为第一列匹配，并且范围10-15在两个范围之间重叠 第2行（文件1）与第3行（文件2）匹配，因为第一列匹配，30-50的范围在10-100范围内。 第4行（文件1）与第4行（文件2）匹配，因为第一列匹配，并且范围22-24在这两个列中重叠。 因此，输出将是在新输出文件中打印的file2的第1、2和4行

希望这些例子能有所帮助

非常感谢你的帮助

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提前谢谢你

如果您使用

join

命令将两个文件按其第一个字段合并（$1），则非常容易：

如果只想将file2行作为输出：

join --nocheck-order <(sort -n file1) <(sort -n file2) | awk '{if ($2 >= $4 && $2 <= $5 || $3 >= $4 && $3 <= $5 || $4 >= $2 && $4 <= $3 || $5 >= $2 && $5 <= $3) {print $1" "$4" "$5;}}' -

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如果您使用

join

命令通过其第一个字段（$1）合并两个文件，则非常容易：

如果只想将file2行作为输出：

join --nocheck-order <(sort -n file1) <(sort -n file2) | awk '{if ($2 >= $4 && $2 <= $5 || $3 >= $4 && $3 <= $5 || $4 >= $2 && $4 <= $3 || $5 >= $2 && $5 <= $3) {print $1" "$4" "$5;}}' -

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我以前试过帮你解决这个问题（）。我建议您提供一个输入和预期输出的示例。否则，您将迫使我们猜测并构建我们自己的测试，而这些测试将不会像您提供给我们的那样准确。对于那些希望帮助你的人来说，这是时间和精力的损失。谢谢，我不知道你已经更新了答案来处理重叠范围的问题。我看一下，如果行得通，我就结束这个问题。我按照上面的要求添加了示例。否。我没有更新它。但是另一个线程更复杂，因为您要求遍历一个文件夹以查找文件并处理其中的每一个文件。我必须用我自己的（猜测的）数据创建所有这些文件，而且比第一眼看到的要多得多。我得到了，但是预期的输出是什么？我明白了，我知道了如何将awk命令放入一个循环“forf in folder”等，所以现在应该可以了，只要有一个awk命令可以用于单个文件1而不是文件2，那么我将把它集成到一个循环中。感谢您的帮助，您的第一个解决方案适用于许多文件。这个额外的问题实际上是针对一个稍有不同的数据集，其中file1中的区域要小得多，因此我忽略了file1中的范围在file2范围内的重叠，这在第一个数据集中从未发生过。所以，谢谢你的努力。我以前曾试图帮助你解决这个问题（）。我建议您提供一个输入和预期输出的示例。否则，您将迫使我们猜测并构建我们自己的测试，而这些测试将不会像您提供给我们的那样准确。对于那些希望帮助你的人来说，这是时间和精力的损失。谢谢，我不知道你已经更新了答案来处理重叠范围的问题。我看一下，如果行得通，我就结束这个问题。我按照上面的要求添加了示例。否。我没有更新它。但是另一个线程更复杂，因为您要求遍历一个文件夹以查找文件并处理其中的每一个文件。我必须用我自己的（猜测的）数据创建所有这些文件，而且比第一眼看到的要多得多。我得到了，但是预期的输出是什么？我明白了，我知道了如何将awk命令放入一个循环“forf in folder”等，所以现在应该可以了，只要有一个awk命令可以用于单个文件1而不是文件2，那么我将把它集成到一个循环中。感谢您的帮助，您的第一个解决方案适用于许多文件。这个额外的问题实际上是针对一个稍有不同的数据集，其中file1中的区域要小得多，因此我忽略了file1中的范围在file2范围内的重叠，这在第一个数据集中从未发生过。因此，感谢您的努力已经有所帮助。我编辑了我的答案，并首先添加了您所需的输出。谢谢，这可能会有所帮助，但我需要输出为第2行中匹配的行，因为此信息稍后将用于引用第3个文件（此处未显示单独的任务。此外，第二个文件中有一些附加信息字段未显示在此处，因为在重叠中不需要这些字段。很抱歉，之前没有指定这些字段，我试图让问题尽可能简单。我删除了其他情况。如果每个文件中有更多参数，只需向打印行添加更多$…即可e、 注意，

if

语句中使用的$value可能会更改。但它很好用。我还想将它用于一些数据，其中文件2对应的数据有不同的列号。例如，文件2中的文件1$1=$3，文件2中的文件1$2=$5，文件2中的文件1$3=$6。我不完全理解您的脚本，所以您能告诉我哪些$value不是o替换到该文件会起作用吗？那么这就足够了，非常感谢。如果文件1中的每一行都有相同数量的字段，那么就很容易理解了。为了理解我的代码，我建议您执行

join file1 file2

，这样您就可以理解awk中的if语句。我编辑了我的答案，并首先添加了所需的输出。谢谢e有帮助，但我需要将输出作为第2行中匹配的行，因为此信息稍后将用于引用第3个文件（此处未显示单独的任务）。此外，第2个文件有一些附加信息字段，此处未显示，因为重叠中不需要这些字段。很抱歉之前未指定此字段，

join --nocheck-order <(sort -n file1) <(sort -n file2) | awk '{if ($2 >= $4 && $2 <= $5 || $3 >= $4 && $3 <= $5 || $4 >= $2 && $4 <= $3 || $5 >= $2 && $5 <= $3) {print $1" "$4" "$5;}}' -

1 5 15
2 10 100
8 22 24