For loop 具有标准输出的for循环
我想为多个输入文件运行两个脚本(gunzip和fastx\u collapser)。gunzip的输出应输入到fastx_collapser。如何在循环函数中执行此操作 我的尝试:For loop 具有标准输出的for循环,for-loop,unix,For Loop,Unix,我想为多个输入文件运行两个脚本(gunzip和fastx\u collapser)。gunzip的输出应输入到fastx_collapser。如何在循环函数中执行此操作 我的尝试: for f in *.gz gunzip -c "$f" | fastx_collapser -Q33 -z -o "${f%}.coll.gz" 您需要一个do和一个done(如果您坚持一行,还需要一些分号): 或: for f in *.gz do gunzip -c "$f" | fastx
for f in *.gz gunzip -c "$f" | fastx_collapser -Q33 -z -o "${f%}.coll.gz"
您需要一个
do
和一个done
(如果您坚持一行,还需要一些分号):
或:
for f in *.gz
do
gunzip -c "$f" | fastx_collapser -Q33 -z -o "${f%}.coll.gz"
done
for f in *.gz; do gunzip -c "$f" | fastx_collapser -Q33 -z -o "${f%}.coll.gz"; done