Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/unix/3.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
For loop 具有标准输出的for循环_For Loop_Unix - Fatal编程技术网

For loop 具有标准输出的for循环

For loop 具有标准输出的for循环,for-loop,unix,For Loop,Unix,我想为多个输入文件运行两个脚本(gunzip和fastx\u collapser)。gunzip的输出应输入到fastx_collapser。如何在循环函数中执行此操作 我的尝试: for f in *.gz gunzip -c "$f" | fastx_collapser -Q33 -z -o "${f%}.coll.gz" 您需要一个do和一个done(如果您坚持一行,还需要一些分号): 或: for f in *.gz do gunzip -c "$f" | fastx

我想为多个输入文件运行两个脚本(gunzip和fastx\u collapser)。gunzip的输出应输入到fastx_collapser。如何在循环函数中执行此操作

我的尝试:

for f in *.gz    gunzip -c "$f"  | fastx_collapser -Q33 -z -o  "${f%}.coll.gz"

您需要一个
do
和一个
done
(如果您坚持一行,还需要一些分号):

或:

for f in *.gz
do
    gunzip -c "$f" | fastx_collapser -Q33 -z -o "${f%}.coll.gz"
done
for f in *.gz; do gunzip -c "$f" | fastx_collapser -Q33 -z -o "${f%}.coll.gz"; done