使用Graphviz和neato时群集边界和节点之间的填充

我想在Graphviz中生成以下图形：

出于所解释的原因，这：

产生以下结果：

以下:

我得到了正确的结果

虽然这样做有效，但我希望能够更直接地控制节点的位置，因此我尝试切换到neato，以便可以使用pos强制节点位置：

graph g
{
   layout=neato;
   node[shape=record, height="0.4", width="0.4"];
   edge[dir=none];

   A [pos="1,3!"];
   B [pos="2,3!"];
   C [pos="3,3!"];
   D [pos="1,2!"];
   E [pos="2,2!"];
   F [pos="3,2!"];
   G [pos="1,1!"];
   H [pos="2,1!"];
   I [pos="3,1!"];

   A -- B -- C;
   D -- E -- F;
   G -- H -- I;
   A -- D -- G;

   subgraph clusterX
   {
      label="Cluster 1";
      A;
      B;
   }

   subgraph clusterY
   {
      label="Cluster 2";
      E; F; H; I;
   }
}

这将产生以下结果：

---

我怎样才能让neato在集群边界和集群内的节点之间添加填充（与dot的方式相同）？

我不喜欢成为一个派对扫兴者，但我认为固定位置和集群的neato方法不会成功

群集支持取决于布局引擎-：

注意，无论好坏，簇子图都不是点的一部分 语言，但仅是某些人遵守的句法惯例 布局引擎

，虽然

fdp

确实支持neato-like布局，但它确实支持

在上面链接的论坛条目中，ERG建议在某个时候使用

gvpr

脚本来实现这一点-可能不是您想要的解决方案

---

顺便说一句，该图不应该是有向图，我收到警告，并将所有

->

替换为

-
谢谢@marapet。看来我得改变我的方法了。我感谢您提供的信息和链接。我已更新问题以删除定向边。
   F; E; I; H; D; G; A; B; C;

graph g
{
   layout=neato;
   node[shape=record, height="0.4", width="0.4"];
   edge[dir=none];

   A [pos="1,3!"];
   B [pos="2,3!"];
   C [pos="3,3!"];
   D [pos="1,2!"];
   E [pos="2,2!"];
   F [pos="3,2!"];
   G [pos="1,1!"];
   H [pos="2,1!"];
   I [pos="3,1!"];

   A -- B -- C;
   D -- E -- F;
   G -- H -- I;
   A -- D -- G;

   subgraph clusterX
   {
      label="Cluster 1";
      A;
      B;
   }

   subgraph clusterY
   {
      label="Cluster 2";
      E; F; H; I;
   }
}