使用python和h5py更新hdf5中的键值

我有一个带有多个键的

hdf5

文件。我想在做一些调整后更新所有关键点的值。怎么做

这是我的密码：

hf=h5py.File(fileName,"r+")
keys=hf.keys()
for i in keys:
    df=hf[i].value
    df=df-np.mean(df)
hf.close()

但是当我在

“r”

模式下读取此文件时，它仍然显示相同的平均值，这意味着它没有更新。知道哪里出了问题吗

上述问题已在提供的答案中解决。然而， 我现在正在尝试校准结果数据。 我使用的代码是：

data = hf[key][...]
hf[key][...] = data*calibration_factor

只是为了简单的校准。但是，它会导致hf[key][…]中的所有零。有什么可能的解决办法吗？感谢您的理解，我在这方面做了很多努力。

如中所述：您希望分配值，而不是创建数据集。在这种情况下，后者无论如何都不起作用，因为数据集是存在的

要分配值，您可以使用Python省略号索引（

…

索引）：

..

的具体工作方式取决于您使用的类/库，特别是

\uuuu getitem\uuuu

的实现方式。对于h5py，您可以参考它，它提供了一些见解、查看或搜索其他好的参考资料（肯定存在）。在此上下文中，我可以告诉您，

…

可用于读取和分配数据集的值。如上所示，

..

已被用作

.value

运算符的替代

在您的示例中出错的是，您假设

df

是指向数据的指针。事实并非如此，这是一份副本。实际上，

df

保存在内存中，而文件中存储的数据保存在这个磁盘上。所以modify

df

不会对您的文件做任何事情（在许多情况下都是这样）。您需要主动地修改文件的内容，正如这个答案所做的那样

---

最后一点注意：这段代码非常简单。例如，它仅适用于没有组的文件。如果你想更一般一些，你必须包括一些检查。

谢谢，我之前看到过，刚才又看到了，是的，几乎是一样的，但请你说明一下[…]的含义，因为我必须使用它两次，因为我必须多次使用它。这有帮助吗：？谢谢，我之前看到过，刚才又看到了，是的，几乎是一样的，但是你能不能告诉我这[…]意味着什么，因为我必须使用它两次，因为我必须使用它多次。因为它不是直接赋值，而是df=dfnp.mean（df），所以在这种情况下如何使用[…]呢？我有一个完整的答案和解释。也许只是一个评论：我认为“键”实际上是指“数据集”。非常感谢，它是这样工作的，我面临着另一个困难类似的数据=hf[键][…]hf[键][…]=数据*校准因子，因为简单的计算数据是由一个因子校准的。不幸的是，这将导致结果数据集中的所有零，hf[key][…]。但是，如果我将它分配给任何其他变量，它就可以正常工作。知道有什么问题吗？

import h5py
import numpy as np

# create some file
# ----------------

hf = h5py.File('example.hdf5', 'w')

hf['/foo'] = np.random.random(100)
hf['/bar'] = np.random.random(100) + 10.

hf.close()

# set all datasets to have a zero mean
# ------------------------------------

hf = h5py.File('example.hdf5', 'r+')

for key in hf:

  data = hf[key][...]

  hf[key][...] = data - np.mean(data)

hf.close()

# verify
# ------

hf = h5py.File('example.hdf5', 'r')

for key in hf:

  print(key, hf[key][...].shape, np.mean(hf[key][...]))

hf.close()