knitr：在循环中调用ggplot2函数不会'；t在带有某些其他打印功能时进行打印

我不确定这是否是一个真正的错误，或者我遗漏了什么，但它来了。 我有一个ggplot函数（plot_data），我想在循环中调用它。我已经将函数包含在它自己的块中。在案例一（标题为“works”的区块）中，调用函数在循环中工作正常，在这种情况下，plot_data函数后面跟着一个barplot。但是，在第二种情况下，plot_data（）函数后面紧跟着一个heatmap，但奇怪的是，heatmap会抑制plot_data函数。无论是否围绕plot_数据函数调用plot（）或print（），都会发生这种情况

有没有办法让ggplots与knitr合作？一个函数调用是如何抑制前一个函数调用的输出的呢

以下代码为我复制了错误：

[preamble omitted]
\begin{document}

<<setup, eval=TRUE, echo=FALSE, cache=FALSE>>=
plot_data <- function(data) {
    require(ggplot2)
    require(reshape)
    d.melt <- melt(data)
    ggplot(data=d.melt, aes(x=X2, y=value, group=X1, colour=X1)) + geom_line(size=.5) +
          scale_x_discrete("") +
          scale_y_continuous("Value")
    }
@

<<works, echo=FALSE, results='asis', out.width='.3\\linewidth', dev='pdf', cache=TRUE >>=
set.seed(10010)
data <- matrix(runif(10000, 1,100), ncol=100)
for (i in 1:10) {
    ind <- sample(1:100, 10)
    plot(plot_data(data[ind,]))
    barplot(ind)
}
@

<<doesnt-work, echo=FALSE, results='asis', out.width='.3\\linewidth', dev='pdf', cache=TRUE >>=
set.seed(10010)
data <- matrix(runif(10000, 1,100), ncol=100)
for (i in 1:10) {
    ind <- sample(1:100, 10)
    plot(plot_data(data[ind,]))  # calling print instead of plot doesn't work either
    heatmap(data[ind,]  )
}
@

\end{document}

[序言省略]
\开始{document}
=
plot_data我想你从knitr

那里问了很多问题。在R中，对齐基础图形和网格图形不是很容易，也不是很有挑战性。我不知道如何使用（package latex

graphics

）来实现这一点，但我认为当你调用

热图时，它是在网格图的同一位置打印的

在调用基本图形之前添加
绘图。新建
，对我来说效果很好：

<<doesnt-work, fig.show='hold',out.width='.3\\linewidth'>>=
  set.seed(10010)
data <- matrix(runif(10000, 1,100), ncol=100)
for (i in 1:3) {
  ind <- sample(1:100, 10)
  print(plot_data(data[ind,]))  # calling print instead of plot doesn't work either
  plot.new()
  heatmap(data[ind,]  )
 }
@

=
种子集（10010）
数据我认为你的函数有错误，熔体的变量被关闭了。这对我很有用：

library(ggplot2)
library(reshape2)
set.seed(10010)
data <- matrix(runif(10000, 1,100), ncol=100)
for (i in 1:3) {
   ind <- sample(1:100, 10)

   d.melt <- melt(data[ind,])
   p<-ggplot(data=d.melt, aes(x=Var1, y=Var2, group=Var1, colour=Var1)) + 
      geom_line(size=.5) +
      scale_x_discrete("") +
      scale_y_continuous("Value")

   print(p)  
   plot.new()
   heatmap(data[ind,]  )
}

库（ggplot2）
图书馆（E2）
种子集（10010）
数据这是一个很长的过程，但是
par（“ask”）
是否正确？每个区块中的
有什么不同（并不是说它改变了问题）？为什么不在
setup
中设置
eval=TRUE
，然后不麻烦调用它呢？sebastian-c:no par（“ask”）的计算结果为false。mnel：我在玩调用块代码的不同方法。按照你建议的惯常方式做同样的效果。我将编辑源代码以反映这一点；可能是一只虫子；欢迎你给我发个短信，我以后会看的