在安装R包时重写特定的编译器标志

我有一个R脚本，它尝试安装许多软件包（省略了所有内容，但只显示了一个）：

然后我就跑

Rscript my_r.r

然后，我注意到它将尝试编译一些C代码：

gcc -m64 -std=gnu99 -I"/usr/include/R" -DNDEBUG -I../inst/include -I"/latest/rsg_comm/r_packages/zoo/include" -I/usr/local/include  -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches   -m64 -mtune=generic  -c any.c -o any.o

是否有一种方法可以要求使用

-O3

和

-mtune=native

本地编译所有包

我注意到有一个建议使用

~/R/.Makevars

。但是看起来

它将覆盖所有编译器标志，而不仅仅是我指定的2个。有没有办法具体说明

我必须下载每个源代码的源代码包，这不如只使用

install.packages（“package\u name”）

方便，它将显示最新版本，并通过镜像等。还是有一种方便的方法

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您可以编辑.R/Makevars文件，并使用

+=

运算符附加所需的标志，例如

CFLAGS+= -O3 -Wall -mtune=native -march=native

如您在下面的评论中所说，如果存在冲突，则使用后一个标志。就从源代码编译而言，您可以通过

install.packages（）

，例如

install.packages("package_name", type = "source")

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将这些标志添加到.R/Makevars文件不会覆盖所有标志，我也不希望它会导致任何问题。也许试一下，看看怎么样？如果出现错误，请进行相应调整。有趣的是，在我的Makevars中，我有

-g-O3-Wall-pedantic-std=gnu99-mtune=native-pipe

标志，并且对动物园软件包没有任何问题，尽管我使用的是macOS so YMMV（）。@jared_mamrot感谢您的建议。我刚刚尝试在

Makevars

中用

CFLAGS=-O3-Wall-mtune=native-march=native安装
zoo
。它替换了
zoo
包中完全指定的所有CFLAG，该包指定了
-O2-g-pipe-Wall-Wp，-D_-FORTIFY_SOURCE=2-feexceptions-fstack protector strong--param=ssp buffer size=4-grecord gcc switches-m64-mtune=generic
。我可以手动调整我的
Makevars
，以获取剩余的标志。但这样做很痛苦，因为我有20多个软件包要安装。你知道如何自动“联合”这个
CFLAGS
吗？事实上，我从你和这件事中得到了一些启发。我使用
Makevars
将我的
CFLAGS
附加到现有的
CFLAGS
中，并期望
gcc
在发生冲突时使用后一个标志（根据帖子）。谢谢
install.packages("package_name", type = "source")