以RMarkdown/knitr格式打印边距

在RStudio中，我的绘图看起来很完美，但是当我通过“编织HTML”按钮生成HTML时，我的边距被切断了

我正在使用基本图形包创建一个简单的条形图

我有一个较大的下页边距，用于容纳x轴上的垂直标签，还有一个较宽的左页边距，用于将y轴标题保留在一些大数字的左侧，例如：

```{r set-graph-options}
par(mar = c(12, 6, 4, 2) + 0.1, mgp = c(4, 1, 0), las = 2)
```

x轴和y轴标签/标题都会受到影响；使用默认的

mgp

设置my

ylab

设置看起来很好，但是使用较大的值时，它似乎被推离了“画布”（或R中的任何术语）

我还注意到knitr/rmarkdown无法识别全局设置

par（）

选项。例如，在设置上述选项后，

barplot（injury_top12，ylab=“Injuries”）

将无法识别

mar

、

mgp

或

las

选项，但如果我将这些选项复制到

barplot（）

调用自身，

las=2

和

mgp=c（4,1,0）

开始工作，但是仍然无法识别

mar

我曾尝试使用命令

R-e“rmarkdown:：render（'Readme.Rmd'）”

从命令行生成HTML，这显示了相同的问题

我使用的是R Studio 0.98.1103，knitr是1.11，rmarkdown是0.8，操作系统是ubuntu linux

示例.Rmd：

```{r echo = F, example-set-par}
library(knitr)
opts_knit$set(cache = FALSE, verbose = TRUE, global.par = TRUE)
par(mar = c(12, 6, 4, 2) + 0.1, mgp = c(4, 1, 0), las = 2)
d <- c("This is a longer than usual label" = 355,
       "Another quite long label" = 144,
       "A third longish label for a barplot" = 222)
```

Plot one depends on values set by `par()`:

```{r echo = F, example-plot-using-par}
barplot(d, ylab = "Arbitrary numbers")
```

Plot two explicitly sets options:

```{r echo = F, example-plot-with-explicit-options}
barplot(d, ylab = "Arbitrary numbers", mar = c(12, 6, 4, 2) + 0.1, mgp = c(4, 1, 0), las = 2)
```

`{r echo=F，示例集par}
图书馆（knitr）
OpthSKNKNET$SET（Cache＝false，VBOSE = TRUE，GUALAL.PAL= TRUE）
par（mar=c（12,6,4,2）+0.1，mgp=c（4,1,0），las=2）
d对于希望直接将答案隐藏在评论和tweet中的人，您的
.Rmd
文件应该如下所示：

---
title: exemple
header of your Rmd
---

```{r}
library(knitr)
opts_knit$set(global.par = TRUE)
```
The important think in the previous chunk is  to put global.par=TRUE 

Plot one depends on values set by `par()`:

```{r}
par(mar=c(5,5,0,0)) #it's important to have that in a separate chunk
``` 
Now we just plot a point with the good margin set by the global `par()`

```{r}
plot(1,1,main="a plot with the margin as set globally")
```

如果不想在输出中包含用于设置全局边距的代码，只需添加：

```{r,include=FALSE}
par(mar=c(5,5,0,0))
``` 

在您不想包含的区块中。
通常在编写文档时，R代码会在新会话中进行计算，因此如果您设置
par
选项，则需要在文档中进行计算。也许你可以举一个可复制的例子？谢谢，@Gregor。当然，我正在文档中设置
par（）
。我添加了一个例子。RMD和屏幕截图的输出。您可以看到感谢@ Yihui，我编辑我的帖子，以反映我的例子的当前状态。RMD，在添加“OPTSKNIKNET$SET（GUALAL.PAL= TRUE）”之后没有变化。我尝试了好几次&验证了没有涉及缓存，只是为了让自己相信这不是我这方面的愚蠢行为。您需要在单独的代码块中设置此选项，以便它可以应用于以下代码块。