气隙环境-安装R包源代码与二进制文件

我们办公室里有一台ubuntu linux服务器，这是一个气隙环境。无法通过internet访问外部网络

不过，我想安装一些R软件包，如

ggplot2、数据库连接器、dplyr、Tidyverse

等。我有10-15个以上的软件包要下载

虽然我无法编写通常的命令

install.packages（“DatabaseConnector”）

，但我必须从CRAN下载压缩文件夹，如图所示

我是R的新手。那么，你能帮我回答下面的问题吗

a） 为什么linux系统没有文件？我只看到

windows二进制文件

和

macOS二进制文件

。我应该下载哪一个

b） 我应该下载

二进制文件

还是

包源代码

？哪一个容易安装

c） 当我从CRAN（如图所示）下载像上面所示的压缩文件那样的包时，依赖项也会自动下载吗？或者我应该查看错误消息并继续逐个下载它们

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d） 由于我在一个空气间隙的环境中工作，所以高效地执行此过程的最佳方法是什么。

在linux下，软件包总是从源代码安装的。linux没有正式的二进制软件包。但是，您的发行版可能会在官方存储库中提供其中一些。Ubuntu有。然而，这些往往是相当旧的版本，通常只限于一手的最重要的软件包。因此，对于linux，您必须下载源程序包。zip文件是针对windows的，无法使用

您还需要下载包的所有依赖项。对于像tidyverse这样的东西，这将是一个巨大的数字。手工追踪这些数据是一项艰巨的工作。最简单的方法可能是在您的气隙系统之外使用一个像miniCRAN这样的包来构建CRAN的选择性副本。您可以指定所需的包，包将下载所有依赖项。然后，您可以将下载的目录复制到服务器上，指向正确方向的

install.packages

，并像往常一样使用

install.packages

进行安装。有关详细信息，请参阅

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您还可能遇到这样的问题：您的系统没有构建所有包所需的所有依赖项。例如，在ubuntu下，您需要安装

libxml2dev

才能安装

xml

软件包。为此，您需要使用ubuntu的软件包管理器。如何在气隙系统上实现这一点是另一个问题

这肯定不是最好的解决方案，但如果您想在本地访问多个软件包（或者更准确地说是所有软件包），这可能是合适的：如果您想安装像tidyverse这样的大型元软件包，您可以下载10-15个以上的软件包。记住，你需要为每个软件包安装整个依赖关系树。@Roland-你知道我应该下载哪个二进制文件吗？或者我应该下载源文件吗？RStudio软件包管理器提供Ubuntu二进制文件，并计划使用气隙机箱