无法使用Rscript命令在服务器上加载R库

我正在使用perl cgi调用

my$call=qxRscript tcga_analysis.R$bg_name$ctr_name$set$user

当我在服务器上使用unix中的Rscript myRscript.R时，它可以工作，但从perl中，我似乎无法加载任何包。我从Apache日志中得到以下错误：

librarygplots中出错：没有名为“gplots”的包

使用.libpath：

> .libPaths()
[1] "/home/sbattaglia/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1"
[2] "/usr/lib64/R/library"
[3] "/usr/share/R/library"

在主文件夹中显示我的个人库

我试着用

library(gplots, lib.loc="/home/sbattaglia/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1")

但是我得到一个lib.loc错误，说那里没有库树。 我甚至在包含库路径的工作目录中创建了一个.Rprofile文件，但没有成功。我还尝试添加pos=1，但没有成功

然而，如果我打开R并调用librarygplots，它就会工作

我需要让它从perl调用Rscript，因为它是使用web界面->perl cgi->R分析某些数据的分析管道的一部分

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谢谢：

我将发布与@floded聊天时得到的答案

基本上，这些库位于服务器上Apache不可见的文件夹中。

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我在.R和.cgi文件所在的位置重新下载了所需的软件包，指定了librarygplots，lib.loc=correctpathtoblibrary，并且成功了：

cgi脚本是否由其他用户运行，可能是apache？可能是权限问题。我是包含R和perl cgi脚本的var/www/html文件夹的所有者。R库的权限似乎是个问题。请尝试chmod-R a+R/home/sbattaglia/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1，也就是说，让所有内容对任何人都可读。@flodel刚刚尝试过，日志上出现了相同的错误：librarygplots中的错误：没有名为“gplots”的包。您可以提供运行ls-ld/home/sbattaglia/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/gplots的输出吗？