R 使用ggplot2绘制混合效果模型

下面的代码绘制混合效果模型的随机效果：

mtcarsSub <- mtcars[,c("wt", "drat", "cyl")]

library(lme4)
mtcarsME <- lmer(drat ~ (1|cyl) + wt, data=mtcarsSub)

mtcarsSub$fixed.effect <- predict(mtcarsME)

library(plyr)
l_ply(list(4, 6, 8), function(x) mtcarsSub[[ paste0("random.effect.cyl", x) ]] <<- mtcarsSub$fixed.effect + ranef(mtcarsME)$cyl[as.character(x),])

library(ggplot2)
ggplot(mtcarsSub, aes(wt, drat, color=factor(cyl))) + 
  geom_point() +
  geom_line(aes(wt, fixed.effect), color="black", size=2) +
  geom_line(aes(wt, random.effect.cyl4), size=2) +
  geom_line(aes(wt, random.effect.cyl6), size=2) +
  geom_line(aes(wt, random.effect.cyl8), size=2)

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mtcarsSub我建议为随机效应制作新的数据帧。为此，我使用函数
ldply（）
和您用来计算每个级别的随机效果的函数。此外，在此新数据框中添加了列
wt
和
cyl
wt
将包含每个级别重复的
mtcarsSub
数据帧中的所有
wt
值<代码>气缸

将包含值4、6和8

mt.rand<-ldply(list(4,6,8), function(x) data.frame(
  wt=mtcarsSub$wt,
  cyl=x,
  rand=mtcarsSub$fixed.effect + ranef(mtcarsME)$cyl[as.character(x),]))

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我试过你的代码，但它似乎产生了与我的文章相同的情节。我需要情节中的每一行都是黑色的。在你的问题中，你说过“让每一条随机效果线的颜色与为共青团显示的颜色相同”。抱歉是的，回答被接受。你能删除这些评论吗？

ggplot(mtcarsSub, aes(wt, drat, color=factor(cyl))) + 
  geom_point() +
  geom_line(aes(wt, fixed.effect), color="black", size=2)+
  geom_line(data=mt.rand,aes(wt,rand),size=2)