在R光栅循环中找不到文件

这里我尝试将CT图像的tiff文件导入R进行分析。我有大约250个tiff文件，我正试图在循环中进行分析。分析首先是裁剪，然后是阈值，然后根据像素强度值计算孔隙度。目前我遇到以下错误：

.rasterObjectFromFilex中出错，带=带，对象类型=RasterLayer，： 无法从此文件创建光栅层对象。文件不存在

工作目录就是上面使用的目录

会话信息：

R版本3.3.3 2017-03-06 平台：x86_64-apple-darwin13.4.0 64位 正在运行：OS X El Capitan 10.11.6

区域设置： [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8 附加基本包： [1] 统计图形GRUTILS数据集方法库

其他随附包裹： [1] RBioFormats_0.0.30 rJava_0.9-8 EBImage_4.16.0 imager_0.40.2 Magritr_1.5 [6] plyr_1.8.4 ROI_0.2-1 rgdal_1.2-6光栅_2.5-8 sp_1.2-4 [11] tiff_0.1-5

通过命名空间加载但未附加： [1] Rcpp_0.12.10 knitr_1.15.1生物仿制药_0.20.0晶格_0.20-35 jpeg_0.1-8 [6] stringr_1.2.0工具_3.3.3平行_3.3.3网格_3.3.3 png_0.1-7 [11] 注册表0.3 abind 1.4-5 bmp 0.2 purrr 0.2.2 fftwtools 0.9-8 [16] slam_0.1-40读取位图_0.1-4 stringi_1.1.5 locfit_1.5-9.1

如有任何帮助，我们将不胜感激。 最好的

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Rob

如评论中所述：

list.files("/Users/Rob/Documents/BMBT5130/Data", full.names=T, pattern="tif$")

应该让你的代码工作

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确保设置full.names=T以确保获得完整的路径名，如果使用的是tif文件，请考虑只搜索以tif结尾的文件，即排除tix.aux文件。

尝试将dir替换为list.files。谢谢，我现在得到的错误是'error:value for'File1.tif'not found'try list.files/Users/Rob/Documents/BMBT5130/Data，full.names=T，pattern=tif$maRtin，谢谢你的帮助！高兴听到！我很乐意接受一个投票/接受的答案，以便将这个问题标记为已解决。

list.files("/Users/Rob/Documents/BMBT5130/Data", full.names=T, pattern="tif$")