基于两列值的R中数据帧子集划分

我有一个以不同基因表达水平为列的数据框，列包括基因所属的时间点和组。我现在想得到某个基因和组对应的基因表达值：

cpm[cpm$group=="dysglyc",colnames(cpm)==gene] 

但是，我还想包括一个特定的时间点：

cpm[cpm$group=="dysglyc" && cpm$timepoint=="A1",colnames(cpm)==gene] 

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这不管用。。。有人能帮忙吗？

我强烈建议您使用

数据.table

库，以便与您的数据一起使用此类数据.frame在

组和
时间点上建立索引。你可以这样做：

cpm = data.table(cmp)  # Convert to data.table
setkeyv(cpm, c("group", "timepoint"))  # Set indexing variables.

然后，您可以使用
data.table
中的
i
表达式轻松地进行子集设置。例如：

cpm["dysglyc"]  # Pull everything dysglyc
cpm[J("dysglyc", "A1")]  # Pull everything group=dysglyc and timepoint=A1
cpm[J("dysglyc", "A1"), gene]  # Use column gene within this subset etc.

您可以开始使用
data.table
“vignette（'data.table'）
”中的vignette。如果您有一个大数据集，需要执行一系列groupby或split-apply-combine操作，那么该包将是一个额外的奖励。
使用hust one即可。请尝试
cpm[cpm$group==“dyglyc”&cpm$timepoint==“A1”，“gene”]
单独运行每个条件表达式非常有用，可以查看整个表达式的哪个部分未按预期工作。运行
cpm$group==“dysgyc”
，
cpm$timepoint==“A1”
，
cpm$group==“dysgyc”&&cpm$timepoint==“A1”
，查看它们是否返回您期望的逻辑向量。当你想发帖提问时，请不要只说“它不起作用”——你应该描述发生了什么，以及你期望的是什么。一个可复制的例子也可以帮助我们帮助你。我简直不敢相信，我一定是打错了什么东西，它只能用一个&我已经找了很长时间了！非常感谢。