RMarkdown YAML中的作者和附属机构

我知道这个问题过去在这个论坛（，）上已经被问过了。在你把这个标记为重复之前，我尝试了所有的答案，但没有成功。大多数问题都是很久以前提出的，一些与

pandoc

相关的更新可能会影响现在的结果

问题是，我正在使用RMarkdown撰写一篇科学论文，并希望将结果导出为HTML、PDF或Word文件

更重要的是，有12位作者在论文上签名一些作者有一个以上的从属关系，而一些作者有相同的从属关系

我的问题很清楚：我如何编辑YAML以包含YAML中所有从属关系的所有作者，以便导出到不同的格式（HTML、PDF、DOC）

我试过这个YAML：

---
title: "My title"
author:
  - name: Mario Modesto-Mata^1,2^
    email: paleomariomm@gmail.com
  - name: Christopher^1^
  - name: Seaghán Mhartain^2^
  - name: Rita Yuri Ynoue^1^
address:
  - code: 1
    address: Instituto de Astronomía, Geofísica e Ciências Atmosféricas, Universidade de São Paulo
  - code: 2
    address: Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo
date: "1 October 2018"
output: 
  pdf_document: 
    number_sections: yes
    toc: yes
    toc_depth: 4
  word_document:
    toc: yes
  html_document:
    css: Scripts accesorios/estiloboton.css
    number_sections: yes
    theme: sandstone
    toc: yes
    toc_depth: 4
bibliography: references.bib
csl: science.csl
---

PDF输出 这是我将

.Rmd

文件导出为PDF时看到的：

我看到的不是作者，而是真实的，没有从属关系

HTML输出 我看到的是作者，而不是所有的联系号码。这些附属机构本身仍然隐藏着

DOCX输出 姓名和从属关系都不会出现在最终Word文件中

我的系统 我使用的是最新的RStudio版本（1.1.453版），运行在LinuxMint19肉桂上

更新：原始示例

---

据我所知，到目前为止，还没有一个“一刀切”的解决方案

如果目标是PDF，我建议RStudio。太棒了

同样适用于docx的解决方案更为困难。一种可能性是使用潘多克。包含两个可帮助您的筛选器：和。（披露：我写了这些。）

将

.lua

文件放在目录中，稍微更改YAML结构，并指示pandoc运行过滤器：

---
title: "My title"
author:
  - Mario Modesto-Mata:
      email: paleomariomm@gmail.com
      institute: [astro, med]
      correspondence: true
  - name: Christopher
    institute: astro
  - name: Seaghán Mhartain
    institute: med
  - name: Rita Yuri Ynoue
    institute: astro
institute:
  - astro: Instituto de Astronomía, Geofísica e Ciências Atmosféricas, Universidade de São Paulo
  - med: Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo
date: "1 October 2018"
output: 
  word_document:
    toc: yes
    pandoc_args:
      - '--lua-filter=scholarly-metadata.lua'
      - '--lua-filter=author-info-blocks.lua'
  pdf_document: 
    number_sections: yes
    toc: yes
    toc_depth: 4
    pandoc_args:
      - '--lua-filter=scholarly-metadata.lua'
      - '--lua-filter=author-info-blocks.lua'
---

这将是PDF输出：

虽然这是Word中的外观：

---

隶属关系和联系信息被添加到正文中，这就是toc显示在正文上方的原因。

我加载了两个过滤器

.lua

，并将其放置在我的目录文件夹中。但是，它给出了一个错误，表示无法识别选项，并且

错误：pandoc文档转换失败，错误为2

。似乎是旧的pandoc版本。你能更新RStudio吗？这是我的RStudio的最后一个版本。有没有办法单独更新pandoc？很有趣。它似乎适用于所示的示例，但不适用于真实的示例。我更新了问题，包括原始问题。真的有什么问题吗？错误与之前的两条评论相同…如果您有其他问题、愿望或功能请求，请毫不犹豫地访问GitHub。您好，您找到了其他解决方案吗？

---
title: "My title"
author:
  - Mario Modesto-Mata:
      email: paleomariomm@gmail.com
      institute: [astro, med]
      correspondence: true
  - name: Christopher
    institute: astro
  - name: Seaghán Mhartain
    institute: med
  - name: Rita Yuri Ynoue
    institute: astro
institute:
  - astro: Instituto de Astronomía, Geofísica e Ciências Atmosféricas, Universidade de São Paulo
  - med: Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo
date: "1 October 2018"
output: 
  word_document:
    toc: yes
    pandoc_args:
      - '--lua-filter=scholarly-metadata.lua'
      - '--lua-filter=author-info-blocks.lua'
  pdf_document: 
    number_sections: yes
    toc: yes
    toc_depth: 4
    pandoc_args:
      - '--lua-filter=scholarly-metadata.lua'
      - '--lua-filter=author-info-blocks.lua'
---