Bash 有没有一种方法可以同时使用qsub和source？_Bash_Shell_Qsub

Bash 有没有一种方法可以同时使用qsub和source？

bash shell

Bash 有没有一种方法可以同时使用qsub和source？,bash,shell,qsub,Bash,Shell,Qsub,我编写了一个shell脚本来分别处理一堆文件，如下所示 #!/bin/bash #set parameters (I have many) ... #find the files and do iteratively for File in $FileList; do source MyProcessing.sh done MyProcessing.sh是调用脚本，主脚本中的变量和函数用于调用脚本现在我想将shell脚本移动到集群，并在迭代中使用qsub。我试过了 #find t

我编写了一个shell脚本来分别处理一堆文件，如下所示

#!/bin/bash

#set parameters (I have many)
...

#find the files and do iteratively
for File in $FileList; do
    source MyProcessing.sh
done

MyProcessing.sh

是调用脚本，主脚本中的变量和函数用于调用脚本

现在我想将shell脚本移动到集群，并在迭代中使用

qsub

。我试过了

#find the files and do iteratively
for File in $FileList; do
    echo "source MyProcessing.sh" | qsub
done

但它不是这样工作的。有人能帮忙吗？提前感谢。

变量和函数是脚本的本地变量和函数。这意味着

sourcemyprocessing.sh

可以工作，但

bash MyProcessing.sh

不能。第二种语法创建一个子shell，这意味着新的Unix进程和Unix进程是隔离的

同样的情况也适用于

qsub

，因为您通过管道调用它：BASH将创建一个新进程

qsub

，并将stdin设置为

source MyProcessing.sh

。它只将这23个字节传递给

qsub

，而不传递其他内容

如果您希望这样做，那么您必须编写一个100%独立于主脚本的新脚本（即，它不能使用任何变量或函数）。然后，您必须阅读

qsub

的文档以了解如何设置它。通常，只有在集群的每个节点上分发了

MyProcessing.sh

的副本后，这样的工具才会起作用

此外，该工具可能不会尝试找出脚本需要的其他数据，因此您还必须将文件复制到集群节点（可能是将它们放在共享文件系统上）。