Bioinformatics Platanus_allee基因组汇编程序组装失败错误

Bioinformatics Platanus_allee基因组汇编程序组装失败错误,bioinformatics,genome,Bioinformatics,Genome,我正在试着运行悬铃木基因组组装程序来组装基因组。但是,当我运行阶段命令时,它会出现以下错误: 我的命令: bio@bio-XPS-8700:~/Fareha/Platanus/Platanus\u allee\u v2.0.2\u Linux\u x86\u 64$。/Platanus\u allee阶段-c out\u contig.fa out\u junctionKmer.fa\Platanus\u allee阶段-c out\u contig.fa out\u junctionKmer.

我正在试着运行悬铃木基因组组装程序来组装基因组。但是,当我运行阶段命令时,它会出现以下错误:

我的命令:

bio@bio-XPS-8700:~/Fareha/Platanus/Platanus\u allee\u v2.0.2\u Linux\u x86\u 64$。/Platanus\u allee阶段-c out\u contig.fa out\u junctionKmer.fa\Platanus\u allee阶段-c out\u contig.fa out\u junctionKmer.fa \-IP1/home/bio/fareha/test/test/SMIX\u测试数据/Unzip/SDNA-270\u 1\u head-3000000.fq/home/bio/fareha/test/SMIX\u测试数据头-3000002> 相位记录

输出:

悬铃木版本:2.0.2

/platanus\u allee phase-c out\u contig.fa out\u junctionKmer.fa platanus\u allee phase-c out\u contig.fa out\u junctionKmer.fa-IP1/home/bio/fareha/test/SMIX\u test\u data/Unzip/SDNA-270\u head-3000000.fq/home/bio/fareha/test/SMIX\u test\u test\u data/Unzip/SDNA-270\u head-3000000.fq 2


有人能帮我解决吗

在platanus2的阶段阶段,我通过安装minimap2和conda解决了这个问题,一切都应该正常

conda install -c bioconda minimap2
这不是语言。我也不确定它是否是序列对齐,如果不适用,请删除该标记。另外,它是关于如何在程序中编写错误处理代码的问题,而不是关于如何解释非编写程序中的错误消息的问题
conda install -c bioconda minimap2