在python3--gdb输出上运行cython时出现分段错误

我一直在试图追踪我继承的cython程序中的segfault的来源。我通过执行

gdb python3

然后

运行my_file.py

在python3下实现了gdb，得到了以下结果：

Program received signal SIGSEGV, Segmentation fault.
__pyx_f_7sklearn_5utils_25graph_shortest_path_leftmost_sibling (__pyx_v_node=<optimised out>)
at /home/my_name/.pyxbld/temp.linux-x86_64-3.4/pyrex/sklearn/utils/graph_shortest_path_strat.c:3195
3195        __pyx_t_1 = (__pyx_v_temp->left_sibling != 0);

基本上，我不是计算图形中每个点之间的距离，而是计算所有点与数组中定义的有限数量点之间的距离。其中，landmark_points是一个整数数组，kng是一个最近邻图

kng = kneighbors_graph(self.nbrs_, self.n_neighbors,mode='distance')

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图的最短路径是.pyx代码。我使用的是版本为0.15.1的Veedrac，谢谢你的帮助。实际上，我将错误追溯到我使用random.randint的事实，当时我本应该用random.sample生成唯一的随机整数。

感谢@Veedrac landmark\u points=[random.randint（0，kng.shape[0]）为范围内的r（self.number\u landmark\u points）]self.dist\u矩阵\uu=图\u最短路径\u strat（kng，landmark_points，method=self.path_method，directed=False）。基本上，我不是计算图中每个点之间的距离，而是计算所有点与数组中定义的有限数量点之间的距离。其中landmark_points是整数数组，kng是最近邻图kng=kneighbors_graph（self.nbrs_，self.n_Neights，mode='distance'））图形最短路径是一个.pyx代码。我使用的版本是0.15.1oops，谢谢你这么做，

graph\u shortest\u path\u strat

的输入有多大？因此，kng是一个4000 x 4000的矩阵，landmark\u points的长度是2000

kng = kneighbors_graph(self.nbrs_, self.n_neighbors,mode='distance')