Ggplot2 我的代码中的哪个命令阻止自定义主题和图例标签工作？

因此，我试图使珊瑚覆盖退化的图形映射。从所附的图表，你可以看到我几乎在那里，我只是试图添加自定义标签，我的传奇和自定义主题，以改变颜色。 这段代码生成一个图形，但似乎忽略了我的自定义主题和标签

谢谢你的帮助

ggplot(CCR, aes(x=as.factor(Year),y=mean, group=Site,color=Site))+
geom_point(size=3)+
labs(y="Hard Coral Cover %",x="Year")+
geom_line(size=2)+
geom_errorbar(aes(ymin=mean-sd,ymax=mean+sd),width=.1,colour="black")+
 scale_y_continuous(limits=c(0,110), expand=c(0,0))+
theme(axis.title.y = element_text(face="bold"),axis.title.x=element_text(face="bold"),legend.title=element_text(face="bold"))+ 
scale_fill_npg(labels=c("Bouy 3","Sampela 1","Pak Kasims","Kaledupa 1","Kaledupa Double Spur","Ridge 1"),guide=guide_legend(title="Site"))+
theme_base()

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您在末尾添加了

theme\u base

，这将覆盖以前的主题设置。将自定义的

主题（…）

移到末尾，它将修改

主题库

，而不是相反。此外，您的颜色/标签也错误，因为您使用了

比例填充

，但映射了变量

颜色=站点

。更改为

scale\u color\u npg（…）

，这将被修复。