Google cloud storage 谷歌基因组工作永无止境

Google cloud storage 谷歌基因组工作永无止境,google-cloud-storage,google-genomics,Google Cloud Storage,Google Genomics,我们使用Google Genomics ReadGroupSets来存储我们的比对数据(BAM文件),它运行得令人惊讶,直到昨天 昨天(2016年8月29日),我们的导入作业(方法:readgroupsets.import)开始处于“运行”状态,但直到现在还没有达到“完成”或错误消息 还有其他人遇到同样的问题吗? e、 g:作业运行1天,不显示错误消息 $ gcloud alpha genomics operations describe identifier done: false meta

我们使用Google Genomics ReadGroupSets来存储我们的比对数据(BAM文件),它运行得令人惊讶,直到昨天

昨天(2016年8月29日),我们的导入作业(方法:readgroupsets.import)开始处于“运行”状态,但直到现在还没有达到“完成”或错误消息

还有其他人遇到同样的问题吗?

e、 g:作业运行1天,不显示错误消息

$ gcloud alpha genomics operations describe identifier

done: false
metadata:
  '@type': type.googleapis.com/google.genomics.v1.OperationMetadata
  clientId: ''
  createTime: '2016-08-30T01:08:57.000Z'
  events: []
  projectId: xxxxxxx
  request:
    '@type': type.googleapis.com/google.genomics.v1.ImportReadGroupSetsRequest
    datasetId: 'xxx'
    partitionStrategy: PER_FILE_PER_SAMPLE
    referenceSetId: ''
    sourceUris:
    - gs://xxx/yyy/zzz.bam
name: operations/identifier
昨天,我们在从Google存储中的对象获取“公共链接”时遇到了暂时的问题,但现在这个问题已经解决了

编辑:我还尝试使用gcloud cli触发导入作业,指向另一个数据集和另一个云项目,但作业仍处于“运行”状态

edit2:我使用谷歌基因组学约3个月,已经成功导入了400多条比对。只是这个星期我有问题


edit3:已解决。我所有的工作都顺利结束。

昨天下午有一个积压工作,我看不到你的工作已经开始了。我会取消操作并再次提交


保罗对此感到抱歉。ReadGroupSets导入当前不起作用,请参见

@paul grosu I重新提交作业,这次在事件中显示预期的消息(无referenceSetId),但作业正在运行2小时。这些导入工作通常不超过40分钟。嗨,Lucas,我完成了OperationMetadata API文档,前几天CH回复了推荐。但梅丽莎只是让我们知道问题来自不同的道路。我回复了GoogleGroups的消息,要求同步到单线程。希望很快就能修好。PaulHi Lucas、CH和Melissa能够修复它,现在队列正在处理积压工作。你好,Paul,感谢您的支持。我们的进口工作现在已经成功地完成了。你好,卢卡斯,我很高兴听到现在一切正常,尽管所有的辛勤工作都是由梅丽莎和陈完成的,他们肯定应该得到大部分的赞扬:)谢谢你,保罗,谢谢你提供的信息。很高兴能在某个地方看到服务状态。不用担心,梅丽莎,谢谢你查看。我回复谷歌群组,将信息同步到一个地方。谢谢,~p