Graph 家谱的布局

我有一个我和几百个亲戚之间的DNA关系数据集（以百分比匹配的形式），几乎所有的远亲。我也有他们和数据集中某些其他成员之间的DNA关系的数据

我希望构建一个网络图，显示相互关系，让Gephi构建一个松散地类似于家谱的东西。但是，即使使用一个小样本数据库，我也无法得到这样的结果图

我希望每个关系（即边缘）都有一个与关系的亲密度相关的“力”，这样远方的亲戚（节点）就会被推得更远。我想让图表根据这些“力”进行自组装，并假设有一个布局，但我还没有找到

我现在把DNA关系放在

weight

列中，根本不使用

interval

列。但是，即使只使用8个亲戚和人工完善的数据，我也必须手动移动节点，使其看起来非常有用

对于这种类型的图形，我应该使用什么样的布局，您还可以提供什么其他建议来实现这一点？

权重

字段是否应随着关系距离的增加而增加或减少

…让Gephi建立一个松散的类似家谱的东西。但是，即使使用一个小样本数据库，我也无法得到这样的结果图

家谱连接后代（大部分）。DNA相似性（以百分比表示）不符合此结构。相关问题

将

库

边

边权重

-过滤器设置为DNA相似性属性可能会有所帮助（但不会产生“松散类似于族谱的东西”）

我希望每个关系（即边缘）都有一个与关系的亲密度相关的“力”，这样远方的亲戚（节点）就会被推得更远。我想让图表根据这些“力”进行自组装

所有布局都是这样工作的。但是，Gephi没有定位功能。第三方候选人包括，和

权重字段应该随着关系距离的增加而增加还是减少

边的权重越大，其连接越强（导致其连接的节点之间的距离越小）。但这与家谱无关

我希望建立一个网络图，显示每个成员之间的相互关系

对于这种类型的图形，我应该使用什么样的布局，您还可以提供什么其他建议来实现这一点

以下步骤强调和强调：

计算模块化

按模块化类对节点进行着色：

外观

节点

分区

模块化类

应用布局<代码>ForceAtlas 2例如（启用了

劝阻集线器

、

LinLog模式

和

防止重叠

）

如有必要，随后应用

压缩

布局。根据（例如）

特征向量中心性

（在应用布局之前）设置节点大小