Groovy 访问配置文件中的复杂密钥

在执行管道期间，我试图访问

nextflow.config

文件中的变量。我想在

run.nf

中以字符串形式提供

image\u standard

，我想接收

eu.gcr.io/proj\u name/image1:latest

作为输出。我找到了在nextflow脚本中获取

.config

文件内容的方法，但我不知道如何访问此特定属性

这是我的

nextflow.config

文件：

process {
    withLabel: image_standard {
        container = "eu.gcr.io/proj_name/image1:latest"
    }
    withLabel: image_deluxe {
        container = "eu.gcr.io/proj_name/image2:latest"
    }
}

run.nf

  x =  workflow.configFiles[0]
  Properties properties = new Properties()
  File propertiesFile = new File("${x}")
        propertiesFile.withInputStream {
        properties.load(it)
    }
    log.info "${properties.process}"

它只打印行：

---

{

您可以尝试使用ProcessConfig类和以下方法来读取配置文件并选择所需的进程：

import nextflow.config.ConfigParser
import nextflow.script.ProcessConfig

def config_file = file("${baseDir}/nextflow.config")
def config = new ConfigParser().setIgnoreIncludes(true).parse(config_file.text)

def process = new ProcessConfig([:])
process.applyConfigSelector(config.process, 'withLabel:', 'image_standard')

println(process.container)