Image processing 在ImageJ或同等格式中裁剪自定义形状（TIFF视频文件）

我有一个.tiff视频文件，其中的纤维正在生长，如下图所示

现在 想象一下，这种纤维将在一条直线上不断生长和收缩。现在我想以某种方式裁剪出视频中仅包含光纤的区域，例如，黑色背景图像

现在，当我播放视频时，我只想看到视频中不断增长的纤维区域，其他地方都是黑色背景

问题：有没有办法在ImageJ中对不规则形状的对象进行“定制”裁剪？

如果您不知道ImageJ是否可以进行这种图像处理，欢迎使用任何其他软件选项

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感谢您的帮助

是的，您可以在ImageJ中执行此操作。如果您能找到一种捕获光纤的阈值方法，您可以将其转换为一个选择（ROI），然后清除“外部”，将其他所有内容变为黑色：

图像>调整>阈值并选择阈值，或使用自动方法之一。但不要应用阈值

编辑>选择>创建选择（将阈值区域变成ROI）

编辑>清除外部（使背景为黑色——假设已将背景颜色设置为黑色）

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如果要缩小窗口，可以在选择处于活动状态时执行“图像>裁剪”。这会将图像裁剪到ROI的矩形边界框中。但是这个尺寸会根据纤维的大小而变化。所以，当光纤最大时，您可能希望这样做。

我不久前接受了您的答案，因为我觉得这是我将得到的唯一答案。我刚刚试了一下你的建议，结果成功了。谢谢