如何向图像添加元数据(使用java代码),然后将其转换为dicom

如何向图像添加元数据(使用java代码),然后将其转换为dicom,java,dicom,dcm4che,Java,Dicom,Dcm4che,我发现了一个java代码,它可以将jpg和Dicom(从该文件中获取元数据)文件转换为最终的Dicom文件。我想做的是将jpg图像转换成Dicom图像,用java代码生成元数据 BufferedImage jpg=ImageIO.read(新文件(“myjpg.jpg”); //将图像转换为字节数组 DataBuffer buff=jpg.getData().getDataBuffer(); DataBufferUShort buffer=新的DataBufferUShort(buff.getS

我发现了一个java代码,它可以将jpg和Dicom(从该文件中获取元数据)文件转换为最终的Dicom文件。我想做的是将jpg图像转换成Dicom图像,用java代码生成元数据

BufferedImage jpg=ImageIO.read(新文件(“myjpg.jpg”);
//将图像转换为字节数组
DataBuffer buff=jpg.getData().getDataBuffer();
DataBufferUShort buffer=新的DataBufferUShort(buff.getSize());
对于(int i=0;ii){
byteBuf.putShort(数据[i]);
i++;
}
//复制头
DicomInputStream dis=新的DicomInputStream(新文件(“fileToCopyheaderFrom.dcm”);
Attributes meta=dis.readFileMetaInformation();
属性attribs=dis.readDataset(-1,Tag.PixelData);
dis.close();
//更改行和列
attribs.setInt(Tag.Rows、VR.US、jpg.getHeight());
attribs.setInt(Tag.Columns、VR.US、jpg.getWidth());
System.out.println(byteBuf.array().length);
//编写文件
attribs.setBytes(Tag.PixelData、VR.OW、byteBuf.array());
DicomOutputStream dcmo=新的DicomOutputStream(新文件(“myDicom.dcm”);
dcmo.writeFileMetaInformation(元);
属性写入(dcmo);
dcmo.close();

我不是工具箱专家(当然还有Java)

“//Copy a header”部分读取源DICOM文件并保存
attributes attribs
变量中的所有属性

然后,您的“//更改行和列”部分会根据需要修改一些属性

然后,您的“//写入文件”部分只需将从源文件读取的属性添加到目标文件

现在,您希望绕过源DICOM文件,通过自己添加属性将普通JPEG转换为DICOM

将“//Copy a header”部分替换到的实例

上述示例中提到的标记仅为示例。您必须自己决定要包含哪些标签。请注意,根据您所处理的SOP类别,规范为标签定义了类型1、1C、2、2C和3。
在添加标签时,您还必须注意正确的VR。规格说明也谈到了这件事。

我无法在这里解释这一切;太宽泛了。

关于dcm4che,我无能为力,但是如果您可以选择使用另一个Java DICOM库,那么使用DeCaMino()这个任务非常简单:

BufferedImage jpg=ImageIO.read(新文件(“myjpg.jpg”);
DicomWriter dw=新DicomWriter();
setOutput(新文件(“myjpg.dcm”);
DICOMMMETADATA dmd=新的DICOMMMETADATA();
写入(dmd,新IIOImage(jpg,null,null),null);
这将使用SOP类“二次捕获”和默认元数据编写符合DICOM的文件

要自定义元数据,请在写入之前将数据元素添加到
dmd
,例如:

DataSet ds=dmd.getDataSet();
ds.set(Tag.StudyDate,LocalDate.of(2011,4,4));
ds.set(Tag.StudyTime,LocalTime.of(15,0,0));
您还可以更改传输语法(从而控制像素数据编码):

免责声明:我是DeCaMino的作者

编辑:正如kritzel_sw所说,我强烈建议不要通过更改像素数据和某些数据元素来修改和现有的DICOM对象,您通常会以不一致的对象结束。更好的方法是从头开始编写对象,最简单的对象来自辅助捕获类。DeCaMino通过生成带有强制数据元素的conform次要捕获对象来帮助您,但它不会帮助您生成成像设备(如CT采集)对象。

只是一个旁注:

attribs.setBytes(Tag.PixelData、VR.OW、byteBuf.array())

VR.OW表示每像素/通道16位。由于要用从JPEG图像读取的像素数据替换像素数据,并且将缓冲区命名为“byteBuf”,我怀疑这是不一致的。VR.OB是每像素/通道图像8位的值表示形式

谈到通道,我知道您希望通过修改现有DICOM图像而不是从头创建新图像来简化DICOM对象的构造。然而,彩色像素数据并不适用于所有类型的DICOM图像。例如,如果您的文件tocopyheaderfrom.dcm是射线照相、CT或MRI图像(或许多其他放射学类型),则不允许向其添加彩色像素数据

此外,每个图像都包含标识信息(研究、系列、SOP实例UID是最重要的标识信息),这些信息应替换为新生成的值


我知道用新的像素数据修改现有的DICOM对象似乎很有吸引力,但这个过程可能比您预期的要复杂得多。在这两种情况下,学习基本的DICOM概念都是不可避免的。

很抱歉对您的答案投了否决票,但它并没有真正回答问题(只是推荐了一个不同的工具包),而且它没有任何提示,即仅仅替换像素数据远远不足以用像素数据创建新的DICOM图像。如果图像的构造方式与您建议的发送给PACS的方式相同,则这可能会对数据完整性产生非常有害的影响,最坏的情况下还会影响患者的健康。DICOM是关于医学成像的,我们不应该忘记“医学”部分。据我所知,问题是“如何将jpg图像转换为DICOM图像,用java代码生成元数据”。我相信我的帖子确实给出了答案。关于数据完整性,您是对的,但DeCaMino defaut SOP类是二次捕获,这意味着一些非原始数据和任何DICOM软件都会识别它。由开发人员添加必要的元数据,使文件对其用途有用,如患者姓名等。您是对的,
Attributes attribs = new Attributes();
attribs.setString(Tag.StudyDate, VR.DA, "20110404");
attribs.setString(Tag.StudyTime, VR.TM, "15");
  dw.setTransferSyntax(UID.JPEG2000TS);