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Java 用于提取密度可达点的DBSCAN库_Java_Cluster Analysis_Weka_Dbscan_Apache Commons Math - Fatal编程技术网

Java 用于提取密度可达点的DBSCAN库

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我正在使用DBSCAN库从一组数据中提取集群。到目前为止,我已经使用Apache通用数学和WEKA库测试了DBSCAN。(我的问题不是DBSCAN实现可以使用哪些库)

到目前为止,我已经了解到DBSCAN中有3种类型的点(根据维基百科):核心点,(密度)可达点和离群点。 我的问题是,我需要提取集群及其边界点或其密度可达点


您知道任何DBSCAN库允许我提取每个集群的密度可达点吗?

在ELKI实现中,您可以使用选项

-algorithm clustering.gdbscan.GeneralizedDBSCAN -gdbscan.core-model
获取仅包含集群核心点的集群“模型”。 集群成员仍然是边界点——密度可以达到,但不是核心。但是,这需要更多内存,因此默认情况下不会启用

在此图像中,内部凸包仅为核心点。对于绿色集群,只有两个核心点。对于噪声点,显然没有嵌套簇

请注意,DBSCAN簇可以是非凸的。这就是为什么绿色星团的核心点位于红色星团的凸包内。并非内部外壳内的每个点都是核心点。甚至在红色星团内部也有一个噪声点,这并不是一个错误——数据集太稀疏,它的epsilon和minPts有太多的局部密度变化。该噪声点的Vincity中的任何点都不能是核心点;但内凸包的任何一点都是确定的

对象将为您提供完整的点列表,而不仅仅是凸面外壳。核心点可通过集群
CoreObjectsModel
访问。只有可视化代码使用凸面外壳,以避免图像过于混乱。此外,默认输出编写器当前不输出此信息。您需要使用Java,或者编写一个定制的
ResultHandler
,以根据需要输出数据,或者甚至在ELKI中执行所有操作


请注意,边界点、噪声点和核心点之间的区别被认为是过时的,并且没有得到较新文献中理论模型的很好支持。

是关于DBSCAN使用ELKI库的相关问题。谢谢Mick,但正如我在前面的描述中所说,我的问题不是关于我可以使用哪些DBSCAN库来聚集点,而是我可以使用哪些DBSCAN库来提取密度可达点谢谢你,Erich,我会给ELKI一个尝试!顺便说一句,我看不到你在答案中发布的图片:你能编辑你的答案以包含它吗?它在这里起作用。它使用如此首选的映像主机。尝试重新加载,并检查是否可以到达