Join 基于字段中具有冗余/缺少值的字段联接文件

我有两个以制表符分隔的文本文件，我希望基于某个字段（例如field1）进行连接。在其中一个文件中，该字段存在冗余，例如：

field1  field2  field3
A   gene1   0.01
A   gene2   0.001
A   gene3   0.02
B   gene4   0.01
B   gene5   0.03
C   gene6   0.004

另一方面，没有冗余：

field1  name    pathway
A   A_name  A_pathway
B   B_name  B_pathway
C   C_name  C_pathway
D   D_name  D_pathway
E   E_name  E pathway

第二个文件还包含要联接的字段中第一个文件中不存在的值。是否可以使用join命令连接这些文件，从而生成以下文件：

field1  field2  field3  name    pathway
A   gene1   0.01    A_name  A_pathway
A   gene2   0.001   A_name  A_pathway
A   gene3   0.02    A_name  A_pathway
B   gene4   0.01    B_name  B_pathway
B   gene5   0.03    B_name  B_pathway
C   gene6   0.004   C_name  C_pathway

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我试着查看一下join的手册页并进行了一些尝试，但似乎无法使其正常工作。

由于您对SQLite有一定的了解，因此使用此SQL工具来处理您的问题可能是最有意义的。首先，使用以下命令将两个CSV文件导入SQLite：

sqlite> create table table1 (field1 text, field2 text, field3 real);
sqlite> .separator "\t"
sqlite> .import table1.csv table1

并对第二个表执行相同的操作：

sqlite> create table table2 (field1 text, name text, pathway text);
sqlite> .separator "\t"
sqlite> .import table2.csv table2

现在数据已在SQLite中，您可以执行以下简单连接以获得所需的结果集：

SELECT t1.field1,
       t1.field2,
       t1.field3,
       t2.name,
       t2.pathway
FROM table1 t1
INNER JOIN table2 t2
    ON t1.field1 = t2.field1

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您有权访问SQL数据库吗？R怎么样？使用这两种工具中的任何一种都很容易处理。我对SQLite有一些经验。我可以用它来连接表吗？