Linux 编制FSL:';致命错误:libxml++/libxml++;。h:没有这样的文件或目录';

Linux 编制FSL:';致命错误:libxml++/libxml++;。h:没有这样的文件或目录';,linux,makefile,compiler-errors,libxml2,neuroscience,Linux,Makefile,Compiler Errors,Libxml2,Neuroscience,我知道这已经提了很多,但是我已经看完了所有其他的答案,没有一个与我相关 我正试图从源代码处编译神经成像软件FSL(我不得不这么做,我的Linux发行版不支持它)。我遵循了所有的说明,大约有80%是编译的。然而,有几个模块并没有成功,它们似乎都可以追溯到试图编译CiftiLib master时出现的问题 根据说明,每当我尝试运行“make”命令时,它都会返回: Makefile:34: warning: overriding recipe for target 'clean' /home/thos

我知道这已经提了很多,但是我已经看完了所有其他的答案,没有一个与我相关

我正试图从源代码处编译神经成像软件FSL(我不得不这么做,我的Linux发行版不支持它)。我遵循了所有的说明,大约有80%是编译的。然而,有几个模块并没有成功,它们似乎都可以追溯到试图编译CiftiLib master时出现的问题

根据说明,每当我尝试运行“make”命令时,它都会返回:

Makefile:34: warning: overriding recipe for target 'clean'
/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/config/common/rules.mk:32: warning: ignoring old recipe for target 'clean'
gcc -c -Wall -ansi -pedantic -Wno-long-long     -m64  -g -O3 -fexpensive-optimizations -m64  -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/boost -g -DCIFTILIB_USE_XMLPP -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/libxml2 -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/libxml++-2.6 -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/lib/libxml++-2.6/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/boost -I./Common -I./Nifti -I./Cifti  -I. -I/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/include  -o Common/XmlAdapter.o Common/XmlAdapter.cxx
In file included from Common/XmlAdapter.cxx:28:0:
Common/XmlAdapter.h:56:10: fatal error: libxml++/libxml++.h: No such file or directory
 #include "libxml++/libxml++.h"
          ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
compilation terminated.
make: *** [Makefile:19: Common/XmlAdapter.o] Error 1
因为我并不是在编译一个foo.c文件,而是在编写一个程序,所以我看到的很多建议似乎并不适用于我。我已经安装了其他帖子(libxml2、libxslt1等)中建议的所有libxml包

我无法理解错误信息的头绪:我根本不熟悉编译C程序(这是我第一次认真尝试从源代码构建)。如果答案是显而易见的,而我只是不认识它,请提前道歉


我使用的是Antergos Linux(Arch内核),我认为这可能是问题的根源,因为所有其他询问这一问题的人似乎都在Debian或Ubuntu上

我一直在试图解决同样的问题。默认情况下,libxml++与FSL绑定,绑定的版本无法编译

解决方案#1:安装并使用较旧的编译器(如GCC 4.8),因为项目的配置是为适应这些旧编译器而设计的 我不能担保这个解决方案,因为我自己没有尝试过(因为显然,我喜欢让自己的生活变得困难),但这可能是你最好的选择

解决方案#2:手动修复问题 注意:这不是一个全面的解决方案,但它可能会为您指明正确的方向

<>强>您的第一个问题很可能是默认情况下使用的编译器使用的是比编译的项目更为新近的C++标准。这会导致输入流和输出流到布尔值的隐式转换失败。您可以通过在makefile配置中乱用编译器标志来解决这个问题,但是修复代码中有问题的部分可能更容易。相关线路(FSL 5.0.11)为:

(我添加了LIB_XML++是为了更好地度量,因为LIB路径是由文件中的其他变量定义的,但我不能100%确定这是必要的。)

再一次,这是我的系统上固定它的原因。根据您下载的源代码版本的不同,可能会有所不同,但至少这是一个起点

修复这些错误后,CiftiLib主目标应编译。然而,如果您的系统与我的系统类似,那么这远非构建过程中唯一的错误。查看
build.log
文件并搜索
错误:
应该可以让您很好地了解哪些项目导致了哪些错误,以及可能需要什么来修复这些错误。这些问题在性质上可能与CiftiLib问题类似

最后提示:如果您的
libgd
项目未能编译,请查看
错误:
消息。它可能会抱怨一些未声明的标识符(
IMG\U FMT\U I420
PLANE\U Y
PLANE\U
PLANE\U V
)。如果您在这些标识符前面加上
VPX
,它应该可以工作。此操作失败的原因是对库的更新删除了不推荐使用的标识符的定义,迫使用户使用新的前缀标识符


这就是我来的地方。我想一年后你不会再为这件事烦恼了,但我将把它留给子孙后代。

我一直在试图解决同样的问题。默认情况下,libxml++与FSL绑定,绑定的版本无法编译

解决方案#1:安装并使用较旧的编译器(如GCC 4.8),因为项目的配置是为适应这些旧编译器而设计的 我不能担保这个解决方案,因为我自己没有尝试过(因为显然,我喜欢让自己的生活变得困难),但这可能是你最好的选择

解决方案#2:手动修复问题 注意:这不是一个全面的解决方案,但它可能会为您指明正确的方向

<>强>您的第一个问题很可能是默认情况下使用的编译器使用的是比编译的项目更为新近的C++标准。这会导致输入流和输出流到布尔值的隐式转换失败。您可以通过在makefile配置中乱用编译器标志来解决这个问题,但是修复代码中有问题的部分可能更容易。相关线路(FSL 5.0.11)为:

(我添加了LIB_XML++是为了更好地度量,因为LIB路径是由文件中的其他变量定义的,但我不能100%确定这是必要的。)

再一次,这是我的系统上固定它的原因。根据您下载的源代码版本的不同,可能会有所不同,但至少这是一个起点

修复这些错误后,CiftiLib主目标应编译。然而,如果您的系统与我的系统类似,那么这远非构建过程中唯一的错误。查看
build.log
文件并搜索
错误:
应该可以让您很好地了解哪些项目导致了哪些错误,以及可能需要什么来修复这些错误。这些问题在性质上可能与CiftiLib问题类似

最后提示:如果您的
libgd
项目未能编译,请查看
错误:
消息。它可能会抱怨一些未声明的标识符(
IMG\u FMT\u I420
- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/istreamparserinputbuffer.cc (line 42)
  return _input;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_input);

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/ostreamoutputbuffer.cc (line 32)
  return _output;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_output);

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/ostreamoutputbuffer.cc (line 39)
  return _output;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_output);
# XML++
LIB_XML++ = ${FSLEXTLIB}
INC_XML++ = ${FSLEXTINC}/libxml++-2.6
INC_XML++CONF = ${FSLEXTLIB}/libxml++-2.6/include
INC_XML2 = ${FSLEXTINC}/libxml2