MATLAB Linux内存不足错误
我们正在运行一个大型的MATLAB程序。经过大约24小时的计算,它会因“内存不足”错误而停止 在发生此错误前不久,进程状态非常健康,进程在一台12 Gb RAM机器上使用了大约3 Gb的内存,交换容量为32 Gb。我们没有理由相信该过程的行为会有很大的不同,在类似过程的迭代3中,前三次迭代会导致2.7GB的峰值。该过程在没有GUI的情况下运行,使用-nojvm选项,使用MatlabR2013A。错误发生在两台不同的计算机上。根据精确的参数化,错误发生在程序中的不同位置 我的问题是:在MATLAB/Linux/64位中,除了普通RAM之外,还有其他资源可以链接到内存不足消息吗?它是否与内存碎片有关?我们如何衡量内存碎片的当前水平 Matlab错误:MATLAB Linux内存不足错误,linux,matlab,Linux,Matlab,我们正在运行一个大型的MATLAB程序。经过大约24小时的计算,它会因“内存不足”错误而停止 在发生此错误前不久,进程状态非常健康,进程在一台12 Gb RAM机器上使用了大约3 Gb的内存,交换容量为32 Gb。我们没有理由相信该过程的行为会有很大的不同,在类似过程的迭代3中,前三次迭代会导致2.7GB的峰值。该过程在没有GUI的情况下运行,使用-nojvm选项,使用MatlabR2013A。错误发生在两台不同的计算机上。根据精确的参数化,错误发生在程序中的不同位置 我的问题是:在MATLAB
CATCH in vsProcessVideosetByFrame.Error using cat
Out of memory. Type HELP MEMORY for your options.
Error in ttClassDetections/horzcat (line 170)
output.data.(fn{j}) = cat(2,temp{:});
进程状态在崩溃前不久出现内存不足消息:
schuttek@pc-07843:~$ cat /proc/14123/status
Name: MATLAB
State: S (sleeping)
Tgid: 14123
Ngid: 0
Pid: 14123
PPid: 1
TracerPid: 0
Uid: 8793 8793 8793 8793
Gid: 100 100 100 100
FDSize: 256
Groups: 4 24 27 30 46 100 108 124 501
NStgid: 14123
NSpid: 14123
NSpgid: 14123
NSsid: 11423
VmPeak: 2744640 kB
VmSize: 2613568 kB
VmLck: 0 kB
VmPin: 0 kB
VmHWM: 1045376 kB
VmRSS: 1025692 kB
VmData: 2095720 kB
VmStk: 132 kB
VmExe: 12 kB
VmLib: 179980 kB
VmPTE: 2920 kB
VmPMD: 24 kB
VmSwap: 0 kB
HugetlbPages: 0 kB
Threads: 18
SigQ: 1/64005
SigPnd: 0000000000000000
ShdPnd: 0000000000000000
SigBlk: 0000000008080006
SigIgn: 0000000000000001
SigCgt: 00000001880804ee
CapInh: 0000000000000000
CapPrm: 0000000000000000
CapEff: 0000000000000000
CapBnd: 0000003fffffffff
CapAmb: 0000000000000000
Seccomp: 0
Cpus_allowed: ffffffff
Cpus_allowed_list: 0-31
Mems_allowed: 00000000,00000001
Mems_allowed_list: 0
voluntary_ctxt_switches: 37
nonvoluntary_ctxt_switches: 5
因为这可能不是OOM杀手(因为
dmesg | grep kill
为空),所以错误应该是MATLAB内部的
一个可能的原因确实是内存碎片;至少有些MATLAB例程似乎明确地请求可能耗尽的连续内存区域。这可以通过pack
-一个协调内存的MATLAB函数来缓解
这是文档页面。请务必注意有关大于2GB的变量的警告
到目前为止,在Windows 10 64位系统上运行似乎可以解决我们的问题。执行一个
dmesg | grep-i kill
,OOM killer通常在终止一个有问题的程序时写一些东西。如果您发布原始的MATLAB错误原始MATLAB错误添加。dmesg | grep-i kill不会产生任何输出。我不相信系统出现了内存不足的情况。你说:“根据精确的参数化,错误发生在程序中的不同位置。”你是指在同一行代码中,但在不同的迭代次数之后,还是在不同的代码行(但总是在迭代3中)出现错误?