Linux 群捕获并行sed

我必须处理一个大文件，并且一直在阅读有关并行命令的内容，以便在使用sed、sort等时尝试使用多个核心处理器。因此，我首先希望每四行更改一行（因为这种文件的命名约定是FastQ格式）

例如，这将是一个四人组，我想修改第一行：

cat sbcc073_pcm_ill_all.musket_default.fastq | head -4

@HWUSI-EAS1752R:29:FC64CL3AAXX:8:65:16525:4289_1:N:0:ACTTGA
GCGAGAGAATGGATGAGTTGATAGTTACACAGCGGTTTTGATATACTGATGCCTTGTATATGTTCGT
+
GHHHHHHHHHHGGEEGEDGGGGH=HHHHHEGDBFF8BED=BAEEEAHHHBD>GGGEEHHHFE>GG@E

通过下一个命令，我完成了工作：

cat sbcc073_pcm_ill_all.musket_default.fastq | head -4 | sed 's#^\(@.*\)_\([12]\).*#\1/\2#'

@HWUSI-EAS1752R:29:FC64CL3AAXX:8:65:16525:4289/1
GCGAGAGAATGGATGAGTTGATAGTTACACAGCGGTTTTGATATACTGATGCCTTGTATATGTTCGT
+
GHHHHHHHHHHGGEEGEDGGGGH=HHHHHEGDBFF8BED=BAEEEAHHHBD>GGGEEHHHFE>GG@E

但是，使用parallel时，似乎无法识别组捕获括号：

cat sbcc073_pcm_ill_all.musket_default.fastq | head -4 | parallel --pipe sed 's#^\(@.*\)_\([12]\).*#\1/\2#'

@HWUSI-EAS1752R:29:FC64CL3AAXX:8:65:16525:4289_1:N:0:ACTTGA
GCGAGAGAATGGATGAGTTGATAGTTACACAGCGGTTTTGATATACTGATGCCTTGTATATGTTCGT
+
GHHHHHHHHHHGGEEGEDGGGGH=HHHHHEGDBFF8BED=BAEEEAHHHBD>GGGEEHHHFE>GG@E

删除反斜杠或使用sed-r时，命令会告诉我：

/bin/bash: -c: line 3: syntax error near unexpected token `('
/bin/bash: -c: line 3: `             (cat /tmp/60xrxvCIRX.chr; rm /tmp/60xrxvCIRX.chr; cat - ) | (sed s#^(@.*)_([12]).*#\1/\2# );'

有人能解释一下吗

多谢各位

parallel --pipe "sed 's#^\(@.*\)_\([12]\).*#\1/\2#'"

尝试在双引号内插入完整命令，如下所示

---

试着在这样的双引号中插入完整的命令。

你应该考虑使用Perl模块，你应该考虑使用Perl模块，谢谢。为什么我需要在这里替换“$”？parallel--pipe“perl-lne”if（$.%4==1）{s/^（@.*）\[12]）./\$1\/\$2/；print}“谢谢。为什么我需要在这里替换“$”？parallel--pipe“perl-lne”if（$.%4==1）{s/^（@.*）\[12]）./\$1\/\$2/；print}”