Memory management 作业分配两倍于我在SLURM上请求的内核

我试图理解为什么我请求的两倍数量的内核被分配到我的sbatch作业中。 据我所知，我的分区有106个线程：

    [.... snake_make]$ sinfo -p mypartition -o %z
S:C:T
2:26:2

然而，我的蛇形怪物的斯巴特设置是这样的：

模块负载蛇形图/5.6.0 snakemake-s snake\u make\u tetragonula--cluster config cluster.yaml--jobs 70
--集群“sbatch-n4-M{cluster.cluster}-A{cluster.account}-p{cluster.partition}”
--延迟等待10

每个作业分配8个核心，而不是4个。当我运行squee时，我发现它一次只能运行多达12个作业，这表明尽管我指定了4个线程，但它为每个作业使用8个内核。另外，当我查看XDMoD上的作业使用情况时，我发现作业中只有一半的CPU被使用。我怎样才能使用尽可能多的CPU，而不是像当前运行的那样使用两倍的CPU？我也试过了

--ntasks=1——每个任务的CPU=4

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这一数字仍然翻了一番，达到了8。谢谢。

Slurm只能分配核心，不能分配线程。因此，在这种配置下：

S:C:T
2:26:2

为每个被请求的内核分配两个线程。无法将两个硬件线程分配给不同的作业

你可以试试看

--ntasks=1 --cpus-per-task=2 --threads-per-core=2

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但是，如果您的计算是CPU密集型的，这可能会使您的工作变慢。

感谢您的澄清。我将每个任务的CPU设置为我根据snakemake规则调用的线程数的一半，现在我的核心数等于分配的线程数，而不是两倍。我将密切关注这些工作，看看它们是否明显较慢。