FUSEKI的MySQL配置

FUSEKI的MySQL配置,mysql,jdbc,jena,fuseki,Mysql,Jdbc,Jena,Fuseki,我需要测试一个特定的数据库解决方案,与使用fuseki+mysql作为三重存储的旧数据库解决方案进行对比。基本上,我所需要做的就是对我以前用SPARQL创建的数据库进行查询。问题是,我似乎无法配置fuseki来为我提供该数据库的端点。我使用普通的标准java编码(JDBC而不使用Jena SDB组件)创建了数据库。我使用的mysql版本是: mysql Ver 14.14 Distrib 5.5.37, for debian-linux-gnu (x86_64) using readline

我需要测试一个特定的数据库解决方案,与使用fuseki+mysql作为三重存储的旧数据库解决方案进行对比。基本上,我所需要做的就是对我以前用SPARQL创建的数据库进行查询。问题是,我似乎无法配置fuseki来为我提供该数据库的端点。我使用普通的标准java编码(JDBC而不使用Jena SDB组件)创建了数据库。我使用的mysql版本是:

mysql  Ver 14.14 Distrib 5.5.37, for debian-linux-gnu (x86_64) using readline 6.3
基本上,我有一个ClassNotFoundException,我无法解决。以下是例外情况的详细信息:

    com.hp.hpl.jena.shared.JenaException: java.lang.ClassNotFoundException: net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadClassNamedBy(AssemblerHelp.java:145)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadArbitraryClass(AssemblerHelp.java:129)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadArbitraryClasses(AssemblerHelp.java:93)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerGroup$ExpandingAssemblerGroup.loadClasses(AssemblerGroup.java:86)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerGroup$ExpandingAssemblerGroup.open(AssemblerGroup.java:79)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerBase.open(AssemblerBase.java:52)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerBase.open(AssemblerBase.java:48)
    at org.apache.jena.fuseki.server.FusekiConfig.processService(FusekiConfig.java:241)
    at org.apache.jena.fuseki.server.FusekiConfig.configure(FusekiConfig.java:149)
    at org.apache.jena.fuseki.FusekiCmd.exec(FusekiCmd.java:364)
    at arq.cmdline.CmdMain.mainMethod(CmdMain.java:97)
    at arq.cmdline.CmdMain.mainRun(CmdMain.java:59)
    at arq.cmdline.CmdMain.mainRun(CmdMain.java:46)
    at org.apache.jena.fuseki.FusekiCmd.main(FusekiCmd.java:101)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:366)
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:355)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)
    at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:308)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)
    at java.lang.Class.forName0(Native Method)
    at java.lang.Class.forName(Class.java:190)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadClassNamedBy(AssemblerHelp.java:144)
    ... 13 more
调用fuseki会将所需的库添加到类路径中(我将它们存储在fuseki主目录中的lib目录中):

我的配置文件:

    # Licensed under the terms of http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0

@prefix :        <#> .
@prefix fuseki:  <http://jena.apache.org/fuseki#> .
@prefix rdf:     <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
@prefix rdfs:    <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@prefix tdb:     <http://jena.hpl.hp.com/2008/tdb#> .
@prefix ja:      <http://jena.hpl.hp.com/2005/11/Assembler#> .
@prefix jumble:  <http://rootdev.net/vocab/jumble#> .
@prefix sdb:     <http://jena.hpl.hp.com/2007/sdb#> .

[] rdf:type fuseki:Server ;
   # Timeout - server-wide default: milliseconds.
   # Format 1: "1000" -- 1 second timeout
   # Format 2: "10000,60000" -- 10s timeout to first result, then 60s timeout to for rest of query.
   # See java doc for ARQ.queryTimeout
   ja:context [ ja:cxtName "arq:queryTimeout" ;  ja:cxtValue "10000,60000" ] ;

   fuseki:services (
     <#service_MySQL_read_only>
   ) .

# SDB
[] ja:loadClass "net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect" .
jumble:SDBConnect rdfs:subClassOf ja:RDFDataset .

<#service_MySQL_read_only> rdf:type fuseki:Service ;
    rdfs:label                      "UF MySQL Service (R)" ;
    fuseki:name                     "MySQL" ;
    fuseki:serviceQuery             "query" ;
    fuseki:serviceQuery             "sparql" ;
    fuseki:serviceUpdate            "update" ;
    fuseki:serviceUpload            "upload" ;
    fuseki:serviceReadWriteGraphStore      "data" ;
    # A separate read-only graph store endpoint:
    fuseki:serviceReadGraphStore       "get" ;
    fuseki:dataset           <#ufmysql_dataset_read> ;
    #fuseki:dataset           <#MySQLStore> ;
        .
<#ufmysql_dataset_read> rdf:type      sdb:DatasetStore ;
    sdb:store <#MySQLStore>
    .
<#MySQLStore> rdf:type jumble:SDBConnect;
    rdfs:label                  "UF MySQL SDB Store";
    sdb:layout                  "layout2";
    sdb:connection
    [ rdf:type sdb:SDBConnection;
        sdb:sdbHost "localhost";
        sdb:sdbType "MySQL";
        sdb:sdbName "EA_db_test";
        sdb:sdbUser "*****";
        sdb:sdbPassword "*****";
        sdb:driver "com.mysql.jdbc.Driver";
    ]
        .
我在fuseki的lib文件夹中找到的jar列表是:

2247124 mag 12  2012 arq-2.8.8.jar
2259436 mag 12  2012 arq-2.8.9-SNAPSHOT.jar
154157 mag 12  2012 jena-iri-0.9.0-incubating.jar
801912 mag 12  2012 mysql-connector-java-5.1.19.jar
6657 mag 12  2012 ReconnectingSDB-0.1-SNAPSHOT.jar
529092 mag 12  2012 sdb-1.3.4.jar
我的FUSEKI版本:

Jena:       VERSION: 2.7.1-incubating-SNAPSHOT
Jena:       BUILD_DATE: 20120426-0201
ARQ:        VERSION: 2.9.1-incubating-SNAPSHOT
ARQ:        BUILD_DATE: 20120430-1956
TDB:        VERSION: 0.9.1-incubating-SNAPSHOT
TDB:        BUILD_DATE: 20120430-2052
Fuseki:     VERSION: 0.2.2-incubating-SNAPSHOT
Fuseki:     BUILD_DATE: 20120501-1232
我应该使用jar版本的任何特定组合?任何关于我可以在哪里找到缺少的jar的指针(如果缺少什么或者如果我需要不同的版本)。或者我只是配置文件有误,我应该使用不同的东西


Thx的帮助看起来像是纯粹的类路径问题,与您拥有的任何其他东西无关。我找到了。这里的要点是:

同样值得注意的是,当您使用java-jar命令行时 选项将Java程序作为可执行JAR运行,然后 CLASSPATH环境变量以及-cp和 -类路径开关将被忽略。在本例中,您可以使用 类路径属性。在清单文件中的短类路径属性中 重写由-cp、-classpath或classpath指定的类路径 环境变量

希望这有帮助

  • 不要混用Jena JAR的版本-使用来自单个发行版的一组JAR
  • -cp和-jar不能一起工作-类路径设置将被忽略

  • 因为(2)
    net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect
    不是来自jar。

    我使用了一个变量进行编译,现在它可以工作了,服务器运行了。我仍然在理解如何查询正确的数据库时遇到一些问题,因为像这样一个简单的查询会抛出500个异常前缀bus:SELECT?app WHERE{bus:2?rel?app}。我认为这是因为它在奇怪的表上执行SELECT,可能我必须定义一个FROM子句。但是,Thx需要关于类路径的答案。这并不能回答问题。net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect来自哪里?这是耶拿发行版的一部分吗?fuseki分布?其他地方?它不是ApacheJena的一部分。
    2247124 mag 12  2012 arq-2.8.8.jar
    2259436 mag 12  2012 arq-2.8.9-SNAPSHOT.jar
    154157 mag 12  2012 jena-iri-0.9.0-incubating.jar
    801912 mag 12  2012 mysql-connector-java-5.1.19.jar
    6657 mag 12  2012 ReconnectingSDB-0.1-SNAPSHOT.jar
    529092 mag 12  2012 sdb-1.3.4.jar
    
    Jena:       VERSION: 2.7.1-incubating-SNAPSHOT
    Jena:       BUILD_DATE: 20120426-0201
    ARQ:        VERSION: 2.9.1-incubating-SNAPSHOT
    ARQ:        BUILD_DATE: 20120430-1956
    TDB:        VERSION: 0.9.1-incubating-SNAPSHOT
    TDB:        BUILD_DATE: 20120430-2052
    Fuseki:     VERSION: 0.2.2-incubating-SNAPSHOT
    Fuseki:     BUILD_DATE: 20120501-1232