Parallel processing .s.GNU并行，一次执行几个文件中的命令

我有一个名为macse.cmd的文件，其中包含1000个要执行的命令，每行1个命令

我想用并行程序一次执行30次。我不在乎他们是按什么顺序执行的，只要他们都是

我尝试了“parallel-j30./macse.cmd”，但这导致它们逐个运行，我甚至不知道如何阻止它们

阿德里安

p、 美国

命令如下所示：

java -jar -Xmx5000m ~/programs/macse_v1.01b.jar -prog alignSequences -seq M715_2100035271/all_unaligned.fasta -out_NT M715_2100035271/aligned_nt.fasta -out_AA M715_2100035271/aligned_aa.fasta
java -jar -Xmx5000m ~/programs/macse_v1.01b.jar -prog alignSequences -seq M715_100078281/all_unaligned.fasta -out_NT M715_100078281/aligned_nt.fasta -out_AA M715_100078281/aligned_aa.fasta
java -jar -Xmx5000m ~/programs/macse_v1.01b.jar -prog alignSequences -seq M715_510001221/all_unaligned.fasta -out_NT M715_510001221/aligned_nt.fasta -out_AA M715_510001221/aligned_aa.fasta
java -jar -Xmx5000m ~/programs/macse_v1.01b.jar -prog alignSequences -seq M715_100094159/all_unaligned.fasta -out_NT M715_100094159/aligned_nt.fasta -out_AA M715_100094159/aligned_aa.fasta

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因此，只有M715编号在命令之间变化。

命令是否总是相同的？如

echo "A"
echo "B"
echo "C"

?

然后您应该将其更改为：

"A"
"B"
"C"

然后运行：

parallel-j30-amacse.cmd echo

其中当然

echo

是您的实际命令

parallel -j 30 < ./macse.cmd

浏览本教程：

man parallel_tutorial

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不幸的是，命令和参数略有变化，编辑初始消息

man parallel_tutorial