Plink如何为Plink创建.map文件？

我试图通过PLINK分析各组间的等位基因频率差异。由于

PLINK

需要PED和MAP文件，我正试图准备两者

不过，我有一些问题

关于地图文件：
我在研究中只发现了17个SNP。以下是我的部分数据：

0 rs10119 0 44903416
0 rs111514285 0 44890428
0 rs1160983 0 44893972
... ...

第四个列表是我在NCBI中找到的物理位置。我将文件保存为.txt，然后将文件扩展名改为.map（我不确定是否正确）

在PLINK中运行命令--file mydata“时，出现“错误：无法打开mydata.map”

如何创建正确的地图文件

这些是我的plink.log 我希望你能尽快帮助我！祝你今天愉快

亲切问候。

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Jingwen

能否请您提供更多关于用作输入的文件名的详细信息以及plink.Vince的完整日志输出，谢谢您的回复！我添加了日志文件，我想我的PED文件可能还可以。它总结了FID IID PID中性表型和SNPs信息。你确定

ADdata.map

与

ADdata.ped

一起存在吗？该错误表明该文件不存在。是的，它确实与ADdata.ped一起存在。我的地图文件是我自己手工编辑的（我按照从网站下载的文件的内容和格式手工填写）。或者你能告诉我如何生成地图文件吗？通过编程软件？R还是别的什么？它在互联网上很少被提及，所以我找不到它…

。地图

格式在这里。染色体名称可能无效，因为您将其设置为

0

。此外，如果您需要更多帮助，请发布每个文件前几行的摘录。

PLINK v1.90p 64-bit (30 Nov 2019)
Options in effect:
  --file ADdata # my data file'name is ADdata
  --out Mydata # the output log file is called "Mydata"

Hostname: gongjingwendeMacBook-Pro.local
Working directory: /Users/gongjingwen/plink_mac
Start time: Thu Dec  5 13:42:36 2019

Random number seed: 1575524556
8192 MB RAM detected; reserving 4096 MB for main workspace.
Error: Failed to open ADdata.map.

End time: Thu Dec  5 13:42:36 2019