Python 3.x 使用graphviz或pydot显示Networkx 2.2多图

我正在使用

python3.4

、

networkx2.2

、

graphviz2.38

和

pygraphviz1.3

在python中创建和显示图形。我有下面一段代码，可以正确地将多重图写入

png

文件

import networkx as nx
import pylab as plt
from networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layout, to_agraph
from networkx.drawing.nx_pydot import write_dot, to_pydot

ic_G = nx.MultiDiGraph()
ic_G.add_nodes_from(['A', 'B', 'C'])
nx.add_path(ic_G, ['A', 'B', 'C'])
#ic_G.add_edge('A','B')

dot_G = to_pydot(ic_G)
print(dot_G)


A = to_agraph(ic_G)
A.layout('dot')
A.draw('abc.png')

控制台以如下所示的正确格式显示多重图形

digraph  {
B;
A;
C;
B -> C  [key=0];
A -> B  [key=0];
}

digraph  {
B;
C;
A;
B -> C  [key=0];
A -> B  [key=0];
A -> B  [key=1];
}

并将以下文件写入同一目录：

当我在多重图中添加重复边时，即当我从上面的代码中取消注释下面的行时，问题就出现了

#ic_G.add_edge('A','B')

我在控制台上得到以下异常

回溯（最近一次调用上次）：文件 “C:\Users\Basit\Anaconda3\envs\python34\lib\site packages\pygraphviz\agraph.py”， 第478行，添加_边 eh=gv.agedge（self.handle，呃，vh，key，_Action.create）key错误：“agedge:无键”

在处理上述异常期间，发生了另一个异常：

回溯（最近一次调用上次）：文件 “D:/GitHub/misc/BP_Graphs/test2.py”，第16行，在 A=到绘图（ic）文件“C:\Users\Basit\Anaconda3\envs\python34\lib\site packages\networkx\drawing\nx\u agraph.py”， 第161行，在to_agraph中 A.add_edge（u，v，key=str（key））文件“C:\Users\Basit\Anaconda3\envs\python34\lib\site packages\pygraphviz\agraph.py”， 第481行，添加_边 eh=gv.agedge（self.handle，呃，vh，key，_Action.find）key错误：“agedge:无键”

to_pydot

功能工作正常，console以点格式打印multigraph的多条边，如下所示

digraph  {
B;
A;
C;
B -> C  [key=0];
A -> B  [key=0];
}

digraph  {
B;
C;
A;
B -> C  [key=0];
A -> B  [key=0];
A -> B  [key=1];
}

---

我的问题是，为什么在多重图中，

to\u agraph

对多条边失败？有没有一种方法可以将

to_pydot

函数的输出转换为

png

文件，而不必使用

to agraph

？

可以使用

write\u png

函数将

Dot

对象写入

png

文件。所以剩下的唯一问题是为什么

to_agraph

在出现多条边的情况下抛出异常？我无法用python 2.7或python 3.5重现您的错误；两者都产生了多图版本ok。这个github问题看起来很相似：一位主要开发人员指出问题在（py）graphviz中。您使用的是哪个版本的

networkx

和

pygraphviz

？我还怀疑这是

pygraphviz

或

graphviz

问题。我可以用pydot来渲染多图。在py2中，pygraphviz是1.3.1，networkx是2.1。在py3中，pygraphviz为1.5，networkx=2.2。