Python中同时从两行中提取信息

我有一个包含多行SAMfields的文件，在不同的制表符分隔的字段中包含信息和DNA序列。每一行都是唯一的样本，但每两行都是耦合的（成对的），因此我想同时从两行中提取信息

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虽然我可以很容易地逐行从这些字段中提取信息，但我希望有一种同时分析这两行的方法。是否有一个循环（或一行一行地操作循环）来完成此操作？

您可以将所有偶数行压缩为奇数行。因此，您可以：

with open(myFile) as inputFile:
    for sequence in zip(inputFile[::2], inputFile[1::2]):
        print(sequence)  # prints lines 0,1 then lines 2,3 etc.

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您可以用所有奇数行压缩所有偶数行。因此，您可以：

with open(myFile) as inputFile:
    for sequence in zip(inputFile[::2], inputFile[1::2]):
        print(sequence)  # prints lines 0,1 then lines 2,3 etc.

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你可以使用itertools做你想做的事。更具体地说。我想这会对你有好处，因为它对记忆很友好，你可以挖掘DNA数据

import itertools

with open(file) as f:
   for l,j in itertools.izip(f,f):
       print l,j

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你可以使用itertools做你想做的事。更具体地说。我想这会对你有好处，因为它对记忆很友好，你可以挖掘DNA数据

import itertools

with open(file) as f:
   for l,j in itertools.izip(f,f):
       print l,j

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更灵活的方法是使用发电机：

def line_pairs(file):
    file_iter = iter(file)
    while True:
        line1 = next(file_iter)
        line2 = next(file_iter)
        yield (line1, line2)

for line1, line2 in line_pairs(file):
    # do what you want with line1 and line2 available at the same time

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现在，如果您意识到需要专门处理某些行（例如，去除空行），您可以修改生成器。

更灵活的方法是使用生成器：

def line_pairs(file):
    file_iter = iter(file)
    while True:
        line1 = next(file_iter)
        line2 = next(file_iter)
        yield (line1, line2)

for line1, line2 in line_pairs(file):
    # do what you want with line1 and line2 available at the same time

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现在，如果您意识到需要专门处理某些行（例如，去除空行），您可以修改生成器。

请将您的问题详细说明一下好吗？也许可以提供一些数据和例子？请再详细说明一下你的问题好吗？也许提供一些数据和示例？不是说它不正确，只是作为一个答案，它似乎缺少任何解释添加了一些解释。它不正确，文件对象不可订阅。不是说它不正确，只是作为一个答案，它似乎缺少任何解释添加了一些解释。它不正确，文件对象不可下标。这不能处理通过line@theorifice你能说得更具体些吗？在一个测试文件中，我在每次迭代中得到2行代码，这是op所要求的。算了吧。我没有意识到在文件对象上迭代会产生行！这对我来说是个新闻。很抱歉。@Theorific是的，你不是很喜欢python吗？@Martijn没问题。如果你决定跟着它，没有其他答案出现，考虑把它标记为接受。line@theorifice你能说得更具体些吗？在一个测试文件中，我在每次迭代中得到2行代码，这是op所要求的。算了吧。我没有意识到在文件对象上迭代会产生行！这对我来说是个新闻。很抱歉。@Theorific是的，你不是很喜欢python吗？@Martijn没问题。如果你决定和它一起去，并且没有其他答案出现，考虑把它标记为接受。