Python 从netCDF文件读取数据时,丢失了\u值属性?
我正在从NCEP/NCAR再分析1的netCDF文件中读取风分量(u和v)数据,以进行一些计算。我正在使用xarray读取文件 在其中一个计算中,我想屏蔽掉低于某个阈值的所有数据,使它们等于缺少的_值属性。我不想用楠的 但是,使用xarray读取数据时,netCDF文件中变量中缺少的_值属性不会复制到包含数据的xarray.DataArray 我找不到从netCDF文件变量复制此属性的方法,使用xarray 下面是我尝试做的一个例子:Python 从netCDF文件读取数据时,丢失了\u值属性?,python,missing-data,netcdf,python-xarray,Python,Missing Data,Netcdf,Python Xarray,我正在从NCEP/NCAR再分析1的netCDF文件中读取风分量(u和v)数据,以进行一些计算。我正在使用xarray读取文件 在其中一个计算中,我想屏蔽掉低于某个阈值的所有数据,使它们等于缺少的_值属性。我不想用楠的 但是,使用xarray读取数据时,netCDF文件中变量中缺少的_值属性不会复制到包含数据的xarray.DataArray 我找不到从netCDF文件变量复制此属性的方法,使用xarray 下面是我尝试做的一个例子: import xarray as xr import num
import xarray as xr
import numpy as np
DS1 = xr.open_dataset( "u_250_850_2009012600-2900.nc" )
DS2 = xr.open_dataset( "v_250_850_2009012600-2900.nc" )
u850 = DS1.uwnd.sel( time='2009-01-28 00:00', level=850, lat=slice(10,-60), lon=slice(260,340) )
v850 = DS2.vwnd.sel( time='2009-01-28 00:00', level=850, lat=slice(10,-60), lon=slice(260,340) )
vvel850 = np.sqrt( u850*u850 + v850*v850 )
jet850 = vvel850.where( vvel850 >= 12 )
#jet850 = vvel850.where( vvel850 >= 12, vvel850, vvel850.missing_value )
最后一行注释是我想做的:使用缺失的_值属性填充vvel850<12的地方。最后一行未注释的内容给了我NaN的,我试图避免的
从netCDF读取数据时,这是xarray的默认行为吗?无论是否,如何从文件变量中获取此属性
另外一个信息:我正在使用PyNGL()绘制等高线图,但它不适用于NaN
谢谢
Mateus在编码
字典中保留“缺少值”属性。其他属性如“单位”或“标准名称”保存在attrs
字典中。例如:
v850.encoding['missing_value']
您可能还对其他一些有助于您的用例的xarray功能感兴趣:
xr.open\u数据集
有一个mask\u和\u scale
关键字参数。这将关闭将缺失/填充值转换为NaN的功能DataArray.to_masked_array
将DataArray
(填充NaN)转换为numpy.MaskedArray
,用于Matplotlib或PyNGL等绘图程序谢谢@jhamman,我使用了第二个建议,效果非常好。