如何使用h5py导入python中的.mat-v7.3文件，但维度顺序相同？

我有几个.mat文件，每个文件都包含一个矩阵。我需要使用h5py在python中导入它们，因为它们已由-v7.3保存。
例如：

*myfile.mat  includes matrix X with the size of (10, 20)*

我在python中使用以下命令：

*import numpy np,h5py
f=h5py.File('myfile.mat','r')
data=np.array(f['X'])
data.shape*    ->    **(20, 10)  Here is the problem!**

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矩阵X被转置。如何导入X而不被转置？

我想你必须接受转置。MATLAB如果按F排序，则按numpy C排序（默认情况下）。沿着线路的某个地方，

loadmat

进行这种转换<代码>h5py没有，因此您必须进行某种转置或重新排序

顺便说一下，

transpose

是

numpy

阵列上最便宜的操作之一

以八度音阶保存（2,3）数组

octave:27> x=[0,1,2;3,4,5]
octave:28> save 'x34_7.mat' '-7' x
octave:33> save 'x34_h5.mat' '-hdf5' x
octave:32> reshape(x,[1,6])
ans =   0   3   1   4   2   5

加载它。形状为（2,3），但如果F有序：

In [102]: x7=loadmat('x34_7.mat')

In [103]: x7['x']
Out[103]: 
array([[ 0.,  1.,  2.],
       [ 3.,  4.,  5.]])

In [104]: _.flags
Out[104]: 
  C_CONTIGUOUS : False
  F_CONTIGUOUS : True
  ...

查看

h5

版本：

In [110]: f=h5py.File('x34_h5.mat','r')

In [111]: x5=f['x']['value'][:]
Out[111]: 
array([[ 0.,  3.],
       [ 1.,  4.],
       [ 2.,  5.]])
# C_contiguous

并且

x5

缓冲区中的数据顺序与倍频程中的顺序相同：

In [134]: np.frombuffer(x5.data, float)
Out[134]: array([ 0.,  3.,  1.,  4.,  2.,  5.])

来自

loadmat

的数据也是如此（尽管我必须用

frombuffer

进行转置来查看它）（要注意）

（有没有更好的方法来改变

x5.data

和

x7.data

具有相同的内容？）

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此模式适用于更高的维度。在MATLAB中，它是变化最快的第一个维度。通过h5py加载，该维度对应于最后一个维度。因此a

x（：，2,2,2）

将对应于a

x[1,1,1，：]

，以及a

x.T[：，1,1]

In [139]: np.frombuffer(x7.T.data,float)
Out[139]: array([ 0.,  3.,  1.,  4.,  2.,  5.])