用Python绘制列表

我试着画出两个列表，一个是用timeit测量时间，另一个是我在循环中运行的次数。我只得到了一个空的情节，所以我觉得有点不对劲。谁能告诉我错在哪里吗？ 这些函数并不是很重要，但我将发布整个过程以提供上下文。 代码如下：

import random
import timeit
import matplotlib.pyplot as plt

def generateSequences(n):

    RandomSequences = []
    dna = ["A","G","C","T"]
    for i in range(int(n)):

        randseq=''

        for i in range(50):
            randseq+=random.choice(dna)

        RandomSequences.append(randseq)

    return RandomSequences

def generatePrefixes(p, RandomSequences):

    First20Chars = [x[:20] for x in RandomSequences]
    RandomChoices = []
    for i in range(p):
        randomPrefix = random.choice(First20Chars)
        RandomChoices.append(randomPrefix)

    return First20Chars, RandomChoices

def searchReadsInList(RandomSequences, RandomChoices):

    start_time = timeit.default_timer()
    Matches_RS_RC = []
    for i in RandomChoices:
        for j in RandomSequences:
            if i in j:
                Matches_RS_RC.append(j)
    elapsed_sRL = timeit.default_timer() - start_time
    return Matches_RS_RC, elapsed_sRL



if __name__ == "__main__":
    count = 10
    while count < 1000:
        RandomSequences = generateSequences(count)
        First20Chars, RandomChoices = generatePrefixes(5, RandomSequences)
        Matches_RS_RC, elapsed_sRL = searchReadsInList(RandomSequences, RandomChoices)
        ListCounts = []
        ListCounts.append(count)
        ListTime = []
        ListTime.append(elapsed_sRL)
        count = count + 10

    plt.plot(ListTime, count)
    plt.xlabel('Time')
    plt.ylabel('# of Reads')
    plt.savefig("TimePlot.pdf")
    plt.show()

随机导入
导入时间信息
将matplotlib.pyplot作为plt导入
def生成序列（n）：
随机序列=[]
dna=[“A”、“G”、“C”、“T”]
对于范围内的i（int（n））：
randseq=''
对于范围（50）内的i：
随机选择（dna）
RandomSequences.append（randseq）
返回随机序列
def generatePrefixes（p，随机序列）：
First20Chars=[x[：20]表示随机序列中的x]
随机选择=[]
对于范围（p）内的i：
randomPrefix=random.choice（前20个字符）
RandomChoices.append（随机前缀）
返回前20个字符，随机选择
def searchReadsInList（随机序列、随机选项）：
start\u time=timeit.default\u timer（）
匹配\u RS\u RC=[]
对于随机选择中的i：
对于随机序列中的j：
如果我在j中：
匹配\u RS\u RC.append（j）
已用\u sRL=timeit.default\u timer（）-开始\u时间
返回匹配项\u RS\u RC，经过的\u sRL
如果名称=“\uuuuu main\uuuuuuuu”：
计数=10
当计数小于1000时：
随机序列=生成序列（计数）
First20Chars，RandomChoices=generatePrefixes（5，RandomSequences）
匹配\u RS\u RC，经过的\u sRL=searchReadsInList（随机序列，随机选择）
ListCounts=[]
追加（计数）
ListTime=[]
追加（已用\u sRL）
计数=计数+10
plt.绘图（列表时间、计数）
plt.xlabel（“时间”）
plt.ylabel（“#of Reads”）
plt.savefig（“TimePlot.pdf”）
plt.show（）

我改进了主功能，您在每次迭代中都清除了列表：

if __name__ == "__main__":
    count = 10
    ListCounts = []
    ListTime = []

    while count < 1000:
        RandomSequences = generateSequences(count)
        First20Chars, RandomChoices = generatePrefixes(5, RandomSequences)
        Matches_RS_RC, elapsed_sRL = searchReadsInList(RandomSequences, RandomChoices)
        ListCounts.append(count)
        ListTime.append(elapsed_sRL)
        count = count + 10

    print ListCounts
    print ListTime

    plt.plot(ListTime, ListCounts)
    plt.xlabel('Time')
    plt.ylabel('# of Reads')
    plt.savefig("TimePlot.pdf")
    plt.show()

如果名称=“\uuuuu main\uuuuuuuu”：
计数=10
ListCounts=[]
ListTime=[]
当计数小于1000时：
随机序列=生成序列（计数）
First20Chars，RandomChoices=generatePrefixes（5，RandomSequences）
匹配\u RS\u RC，经过的\u sRL=searchReadsInList（随机序列，随机选择）
追加（计数）
追加（已用\u sRL）
计数=计数+10
打印列表计数
打印列表时间
plt.绘图（列表时间、列表计数）
plt.xlabel（“时间”）
plt.ylabel（“#of Reads”）
plt.savefig（“TimePlot.pdf”）
plt.show（）

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您的列表仅存储两个值：[990]和[0.0012807846069335938]。打印时使用

plt.plot（ListTime，ListCounts）

。