Python 迭代字典中的值以替换目录中的文件名

全部。我有一个csv文件，在那里我安排了DNA样本ID，我将其发送到96孔板中进行测序。这一点很重要，因为当我们从测序设备取回平板时，色谱图文件的标题很简单，例如5-3-13-g-Templates_A01_Primer-g.ab1

csv以制表符分隔，如下所示：（96口井，12列[1-12]，8行[A-H]）：

每次我用手拿回盘子时，我都会花时间重新命名96个文件，而不是用我事先准备好的文件来引导我装入盘子，这样我就不会把盘子弄坏（错误的井中有错误的DNA），通过前缀来识别位置（例如A06…H06），将其与目录中的文件名匹配，因为它们共享相同的单元格位置，因此脚本将迭代整个csv文件并以以下形式重命名所有文件：5-3-13-G-Templates_A06_Primer-G.ab1将变为A06_Eulophia_euglossa_ITS1.ab1

我已经编写了Python脚本的一部分，但是我很难想象下一步：

import csv
data = csv.DictReader(open('Template.csv', 'rU'), delimiter='\t')
for row in data:
    values = row.values()
    values.sort()
    #Provides values by row in order from left to right

这就是我被困的地方。既然我有了这些清单，接下来该怎么办？循环？我只是在设想解决方案时遇到了一些问题

我想解决方案的一部分应该是下面的代码，根据我找到的另一个答案进行修改：

folder = r"/home/ryan/Desktop/MMEE/plateG" #Make sure only the .ab1 files are in this directory
import os
for root, dirs, filenames in os.walk(folder):
    for filename in filenames:
        fullpath = os.path.join(root, filename)
        filename_split = os.path.splitext(fullpath)
        filename_zero, fileext = filename_split
        os.rename(fullpath, SOMEVARIABLE + fileext)

上面的部分，我用os.rename重命名文件，并使用“SOMEVARIABLE”，我认为上面列表中的名称应该输入到文件名中。但如何做到这一点目前超出了我的技能水平。或者我只是累了

任何帮助都将不胜感激。我希望这足够清楚，但如有必要，我可以作出澄清。干杯

编辑以添加： 旧文件名和新文件名仅共享位置ID，例如A01、B06、H12。新的文件名将取自csv文件，因此名为5-3-13-G-Templates_F08_Primer-G.ab1的文件将从第8列中提取名称，但只提取标题中带有“F08”的名称。行是A到H。基本上，我想从位置RowF，Column8（虽然我现在没有行标题）中选择文本，并将该文本应用到包含F08的文件名。我认为可能有一种方法可以匹配生成的值列表中的每个子字符串A01到H12，并将每个子字符串中的文本拉到它们要替换的旧文件名中，因为它们也与相同的子字符串A01到H12匹配

我希望以这种方式重命名文件：（NB-A01到D04是空白井，因此它们除了ID之外没有其他标签）

处理CSV文件，收集所有新文件名，并将样本ID映射到新名称

遍历目录，找到所有文件，从它们的基本名称中提取样本id，并从第一步创建的

id\u映射中查找新名称。根据新名称重命名

导入csv
导入操作系统
进口稀土
#首先
data=csv.DictReader（打开（'csv.csv'，'r'），分隔符=“\t”）
id_map={}
对于数据中的行：
对于第行中的名称。值（）：
#在单元格中以列表形式查找所有样本ID，应仅获取1个ID
ids=re.findall（r'[A-H][0-9]{2}'，名称）
如果len（ids）！=1:
打印“在”+名称处混淆”
id\u映射[ids[0]]=名称
#第二
文件夹='files/'
对于os.walk（文件夹）中的根目录、目录和文件：
对于文件中的文件名：
fullname=os.path.join（根目录，文件名）
basename，扩展名=os.path.splitext（文件名）
#在basename中查找所有示例ID，应仅获取1个ID
ids=re.findall（r'[A-H][0-9]{2}'，basename）
如果len（ids）！=1:
打印“+os.path.join（根目录，文件名）”处的“混乱”
如果id_映射中的id[0]：
新建\u name=id\u映射[ids[0]]+扩展名
重命名（全名，os.path.join（根，新名称））
其他：
打印“未找到“+全名+”的新名称”

我认为您提供了太多的细节，但忽略了重要的部分，即旧文件名和新文件名如何匹配？从CSV表格的第6列或表格的任何列中，从何处获取新文件名？CSV中有96个字段和96个要重命名的文件，字段如何与特定文件匹配？展示更多的例子。感谢你的洞察力；为了清晰起见，我将尝试添加到编辑中。我想我提供了匹配信息：旧文件名和新文件名将只共享单元格ID，例如A01、B06、H12。新文件名将取自CSV文件，因此名为5-3-13-G-Templates_F08_Primer-G.ab1的文件将从第8列中提取名称，是的，但只有标题中带有“F08”的文件。行是A到H。基本上，我想从位置RowF，Column8（虽然我现在没有行标题）中选择文本，并将该文本应用到包含F08的文件名中。太棒了！这很好地发挥了作用；非常感谢你。我一时忘记了

re.findall

。当我们得到序列后，这肯定会节省我在实验室的时间。

folder = r"/home/ryan/Desktop/MMEE/plateG" #Make sure only the .ab1 files are in this directory
import os
for root, dirs, filenames in os.walk(folder):
    for filename in filenames:
        fullpath = os.path.join(root, filename)
        filename_split = os.path.splitext(fullpath)
        filename_zero, fileext = filename_split
        os.rename(fullpath, SOMEVARIABLE + fileext)

5-3-13-G-Templates_E04_Primer-G.ab1 > E04_Dipodium_6052_ITS1.ab1
5-3-13-G-Templates_F04_Primer-G.ab1 > F04_Dipodium_6052_ITS4.ab1
5-3-13-G-Templates_G04_Primer-G.ab1 > G04_Dipodium_6055_ITS1.ab1
5-3-13-G-Templates_H04_Primer-G.ab1 > H04_Dipodium_6055_ITS4.ab1
5-3-13-G-Templates_A05_Primer-G.ab1 > A05_Grammatophyllum_scriptum_ITS1.ab1
5-3-13-G-Templates_B05_Primer-G.ab1 > B05_Grammatophyllum_scriptum_ITS4.ab1
...