Python软件包setup:setup.py，可自定义以处理封装的fortran

我有一个python包要分发。我有软件包设置，可以下载tarball，解压并使用以下工具安装：

python setup.py install

这很好用

我还想将这个包上传到PyPi，并使用pip安装它

但是，该包包含f2py包装的fortran，需要在生成时编译它，并将生成的.so文件移动到最终安装文件夹。我不知道如何使用以下方法进行此操作：

python3 setup.py sdist

其次是：

pip3 install pkg_name_here.tar.gz

原因是当我跑步的时候

python3 setup.py sdist

正在运行自定义命令，其中一部分命令试图将已编译的*so文件移动到尚未创建的安装文件夹中。我使用的代码大纲示例如下：

在我的实例中，custom_command（）编译和包装fortran，并将lib文件复制到安装文件夹中

我想知道的是，是否有一种方法可以在安装pip时只运行这些自定义命令？i、 e避免在打包期间运行自定义_命令（），而仅在安装期间运行

更新 根据Pierre de Buyl的建议，我已经取得了一些进展，但仍然没有取得进展

setup.py文件当前看起来像：

 def setup_f90_ext(parent_package='',top_path=''):
    from numpy.distutils.misc_util import Configuration
    from os.path import join

    config = Configuration('',parent_package,top_path)

    tort_src = [join('PackageName/','tort.f90')]
    config.add_library('tort', sources=tort_src,
                          extra_f90_compile_args=['-fopenmp -lgomp -O3'],
                          extra_link_args=['-lgomp'])

    sources = [join('PackageName','f90wrap_tort.f90')]

    config.add_extension(name='',
                          sources=sources,
                          extra_f90_compile_args=['-fopenmp -lgomp -O3'],
                          libraries=['tort'],
                          extra_link_args=['-lgomp'],
                          include_dirs=['build/temp*/'])

    return config

if __name__ == '__main__':

    from numpy.distutils.core import setup
    import subprocess
    import os
    import sys

    version_file = open(os.getcwd()+'/PackageName/'+ 'VERSION')
    __version__ = version_file.read().strip()


    subprocess.call(cmd, shell=True)

    config = {'name':'PackageName',
              'version':__version__,
              'project_description':'Package description',
              'description':'Description',
              'long_description': open('README.txt').read(),#read('README.txt'),
}
    config2 = dict(config,**setup_f90_ext(parent_package='PackageName',top_path='').todict())
    setup(**config2)   

其中，f90wrap_侵权行为.f90是f90wrapped fortran文件，而侵权行为.f90是原始fortran文件

如果我运行该命令两次，该文件将与python setup.py install一起使用

第一次运行

python setup.py install

时，出现以下错误：

    gfortran:f90: ./PackageName/f90wrap_tort.f90
f951: Warning: Nonexistent include directory ‘build/temp*/’ [-Wmissing-include-dirs]
./PackageName/f90wrap_tort.f90:4:8:

     use tort_mod, only: test_node
        1
Fatal Error: Can't open module file ‘tort_mod.mod’ for reading at (1): No such file or directory
compilation terminated.
f951: Warning: Nonexistent include directory ‘build/temp*/’ [-Wmissing-include-dirs]
./PackageName/f90wrap_tort.f90:4:8:

     use tort_mod, only: test_node
        1
Fatal Error: Can't open module file ‘tort_mod.mod’ for reading at (1): No such file or directory

我之所以将

include_dirs=['build/temp*/']

参数放在扩展中，是因为我在运行

python setup.py install

后注意到第一次在那里构建并存储

include_mod

我不明白的是如何正确链接，以便一步完成所有操作

---

有人能看到我遗漏了什么吗？

在谷歌搜索了一下之后，我建议如下：

使用NumPy的distutils

对普通Fortran文件使用

add_库

关键字（见）。这会将Fortran文件构建为库，但不会尝试使用f2py与它们进行接口

使用f90wrap预构建f90包装，将其包含在包存档中，并在扩展中指定这些文件作为源文件

我没有测试整个解决方案，因为它有点费时，但这是SciPy为他们的一些模块所做的，请参阅

NumPy的文档中有一项已结束

编辑1：在使用

include_dirs=['build/temp.linux-x86_64-2.7']）

config构建之后，我在第一次构建尝试时获得了这个目录结构

build/lib.linux-x86_64-2.7
├── crystal_torture
│   ├── cluster.py
│   ├── dist.f90
│   ├── f90wrap_tort.f90
│   ├── graph.py
│   ├── __init__.py
│   ├── minimal_cluster.py
│   ├── node.py
│   ├── node.pyc
│   ├── pymatgen_doping.py
│   ├── pymatgen_interface.py
│   ├── tort.f90
│   ├── tort.py
│   └── tort.pyc
└── crystal_torture.so

---

您使用什么工具绑定Fortran代码？（f2py、iso_c_binding、其他？）您是否知道NumPy为此目的进行的distutils修改？我使用f2py和f2py-f90wrap。不幸的是，据我所知，Distils扩展无法处理f90wrap部件。路径

build/temp*

不是实际路径。如果只有一个这样的临时目录，请从glob import glob添加

，然后改用
include_dirs=glob（'build/temp*/'）
。尝试过这个方法后，Pierre也不起作用。如果上面的代码不够清晰，可以从中删除完整的包。仍然不知道如何让它工作……我用
include\u dirs=['build/temp.linux-x86\u 64-2.7']）构建了它。
您现在有什么错误？感谢您的发现-看起来很有希望，但我似乎无法让它正常工作。我我更新了帖子，加入了你的建议。太棒了，你说得对。现在我只需要设置一个函数，来计算出任何机器上这个文件夹的名称，我应该很乐意去做。万分感谢！
build/lib.linux-x86_64-2.7
├── crystal_torture
│   ├── cluster.py
│   ├── dist.f90
│   ├── f90wrap_tort.f90
│   ├── graph.py
│   ├── __init__.py
│   ├── minimal_cluster.py
│   ├── node.py
│   ├── node.pyc
│   ├── pymatgen_doping.py
│   ├── pymatgen_interface.py
│   ├── tort.f90
│   ├── tort.py
│   └── tort.pyc
└── crystal_torture.so