我们可以'；t装载R包

我将R升级到v2.14.0，并在升级过程中决定将标准软件包存储库移动到Dropbox，以便笔记本电脑和台式机始终保持同步。 我在

.Renviron

中设置了我的

R_LIBS=/Dropbox/ToolBox/R/packages

，当打开Rstudio或R.app（mac）时，我会收到以下命令：

> Sys.getenv("R_LIBS")
[1] "/Dropbox/Toolbox/R/packages"

> .libPaths()
[1] "/Dropbox/Toolbox/R/packages"      
[2] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.14/Resources/library"
[3] "/Applications/RStudio.app/Contents/Resources/R/library

但是当我在.Snw（Textmate+swave）中运行相同的命令时，我得到：

如上所述，当我从swave调用R时，它只会选择标准存储库。我创建了

Renviron.site

，

Rprofile.site

，阅读了

帮助（启动）

，但没有成功

有人能告诉我（一步一步）如何解决这个问题吗

更新： 当我从R中删除我的.Snw时，它会选择所有正确的文件夹。我不知道为什么从textmate完成时会做一些不同的事情

---

有什么想法吗？

试着在

“Rprofile.site”

文件中放一行这样的内容，该文件位于

$R\u HOME/etc/

中。（此处，

$R\u HOME

是在活动的

R

会话中运行

R.HOME（）

返回的目录。）

（您还需要删除（可能是暂时删除）以下目录中的任何

“.Rprofile”

文件：（a）您的主目录；和（b）当前目录（从中启动R/swave）。）

然后，如果这不能彻底解决问题（对我来说确实有效），请保存并将LaTeX应用于包含以下区块的骨架

.Snw

文档

<<>>=
R.home()
.libPaths()
@

=
R.home（）
.libPaths（）
@

---

输出应该为问题的根源提供一些有用的提示。

多亏了Josh，我意识到问题不在于R本身，而在于textmate

Swave和R捆绑包都没有选择我的本地存储库，因为选项——vanilla在两个捆绑包中都设置为默认值

这是我的解决方案：

R束

打开终端并转到$HOME/Library/Application Support/TextMate/Pristine Copy/Bundles

键入

>mate R.tmbundle

这将直接在textmate中打开R bundle

在support文件夹中有一个名为tmR.rb的文件

向下滚动，直到找到以下行：

stdin、stdout、stderr、pid=my_popen3（“R--vanilla--slave--encoding=UTF-82>&1”）

删除--vanilla选项并保存

斯维夫束

在Textmate中，转到捆绑包>捆绑包编辑器>显示捆绑包编辑器

单击Swave bundle展开

转到swave、Typset和View并向下滚动，直到看到以下行：

echo-e“setwd（“$SW”）\nSweave（“$TM_FILEPATH”）”| R--vanilla--quiet | pre

将“香草”更改为“保存”

重新加载包

---

快乐的日子又回来了：-）

+1记录你在R的这一令人困惑的方面所做的研究。这可能与你如何开始学习有关；这个问题是关于一个类似的问题，TeXShop做了一些不同于仅在命令行上运行的事情，因此必须以不同的方式更改正确的环境变量。我照你说的做了，不幸的是没有成功。这是来自上述区块的输出：R.home（）[1]“/Library/Frameworks/R.framework/Resources”>.libpath（）[1]“/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.14/Resources/Library”，这似乎是

R.home（）

的一个奇数值（尽管在Mac上可能会出现）。给定默认的

.libpath（）

值所指向的目录，我希望看到更像

“/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.14/Resources”

。在我的电脑上，

R.home（）

返回

“C:/R/R-2.14.0”

，该目录包含

R\u home/library

和

R\u home/etc

（包含

“Rprofile.site”的目录）

这似乎与TextMate启动Swave的位置有关。要确认这一点，您是否可以在R会话中尝试

Swave（“docName.Snw”）

（而不是从命令行运行Swave或让TextMate启动它）？Josh你是对的。当我从R中保存文件时，它会正确地拾取所有文件。所以我想知道当我从textmate中保存文件时发生了什么？真的不知道，因为这本质上是一个textmate问题。至于解决方案，你可以尝试将

etc/Rprofile.site

放在textmate用作

R.home（）的目录中

运行swave时的目录为您保存。为了从其他人那里获得帮助，您可以突出地编辑您的问题，说明您所学到的知识。此外，您可以对这个答案进行投票，因为它确实指向了问题的根源，正如我所预期的那样；）最后，请使用您最终找到的任何解决方案进行更新。

.libPaths(c("/Dropbox/Toolbox/R/packages", 
            .libPaths()))

<<>>=
R.home()
.libPaths()
@