用deSolve解R-导数数误差中的常微分方程
我试图使用用deSolve解R-导数数误差中的常微分方程,r,ode,R,Ode,我试图使用deSolve包来处理一组方程作为辅助变量的ODE。我一直得到一个错误,导数的数目与初始条件向量的长度不同。我应该换什么 # rm(list=ls()) library(deSolve) exponential=function(t,state,parameters){ with(as.list( c(state,parameters)), { #Aux. Var. fX2 = pmax(0,1-(1-(d2/r12)*(X2/K2))) fX1 = X1/(
deSolve
包来处理一组方程作为辅助变量的ODE。我一直得到一个错误,导数的数目与初始条件向量的长度不同。我应该换什么
# rm(list=ls())
library(deSolve)
exponential=function(t,state,parameters){ with(as.list( c(state,parameters)), {
#Aux. Var.
fX2 = pmax(0,1-(1-(d2/r12)*(X2/K2)))
fX1 = X1/(X1+k1);
# equations (ODE)
dX1 = C-((d1)*(X1))-(r12)*(X2)*fX2*fX1 # differential equaion
dX2 = r12*(X2)*fX2*fX1-((d2)*(X2))
return(list(c(dX1, dX2)))
})
}
# -- RUN INFORMATION
# Set Initial Values and Simulation Time
state = c(X1=2,X2=0.01,K2= 10)
times=0:100
# Assign Parameter Values
parameters = c(d1=0.001, d2=0.008, r12=0.3,C=0.5,k1= 0.001)
for (i in 1:length(times)){
out= ode(y=state,times=times,func=exponential,parms=parameters)
}
Error in checkFunc(Func2, times, y, rho) :
The number of derivatives returned by func() (2) must equal the length of
the initial conditions vector (3)**
错误来自定义函数中的
返回
:
您的输入参数y
的长度为3,但您只返回2个值,这就是错误。你可以用电脑解决你的问题
return(list(c(X1, X2, K2)))
另一种可能是将K2
带到参数中,那么您的旧返回值是正确的。您必须确定K2
是变量还是参数
顺便说一句:为什么是时间循环?我认为这是没有必要的,因为ode是在您提交给ode
函数的时间间隔内求解的
out= ode(y=state,times=times,func=exponential,parms=parameters)
错误来自定义函数中的返回
:
您的输入参数y
的长度为3,但您只返回2个值,这就是错误。你可以用电脑解决你的问题
return(list(c(X1, X2, K2)))
另一种可能是将K2
带到参数中,那么您的旧返回值是正确的。您必须确定K2
是变量还是参数
顺便说一句:为什么是时间循环?我认为这是没有必要的,因为ode是在您提交给ode
函数的时间间隔内求解的
out= ode(y=state,times=times,func=exponential,parms=parameters)