在OSX Yosemite上使用英特尔composer编译的R上安装Rcpp

尽管使用英特尔编译器套件Vr.2015.0.077成功编译了

R-3.1.2

，包括2014年末运行Yosemite（概述）的MacBook Pro上的

MKL

，我无法安装优秀的

Rcpp

软件包，到目前为止，我一直在通过针对Mavericks的预打包二进制

R

享受这个软件包。现在，我想加快一点速度，特别是使用

OpenMP

，它似乎与默认的

clang

不兼容。我知道OpenMP/clang项目，但似乎在约塞米蒂岛上的安装仍然不可靠

除了在

make-j8

过程中多次提到strtime中的

警告外，
make-install
成功完成，我能够在新编译的
R
上安装大多数软件包。但是，
Rcpp
程序包出现以下故障：

> install.packages("Rcpp")

Warning in strptime(xx, f <- "%Y-%m-%d %H:%M:%OS", tz = tz) :
  unknown timezone 'Asia/Kolkata'
Warning in strptime(xx, f <- "%Y-%m-%d %H:%M:%OS", tz = tz) :
  unknown timezone 'GMT'
Warning in strptime(xx, f <- "%Y-%m-%d %H:%M:%OS", tz = tz) :
  unknown timezone 'America/New_York'
* installing *source* package ‘Rcpp’ ...
** package ‘Rcpp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
Warning in as.POSIXlt.POSIXct(x, tz) : unknown timezone 'GMT'
Warning in as.POSIXlt.POSIXct(x, tz) :
  unknown timezone 'America/New_York'
** libs
icpc -I/Users/username/R-3.1.2/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -I/sw/include -I/usr/local/include    -fPIC  -g -O3   -c Date.cpp -o Date.o
In file included from ../inst/include/Rcpp/Vector.h(69),
                 from ../inst/include/Rcpp.h(38),
                 from Date.cpp(31):
../inst/include/Rcpp/vector/swap.h(35): error: "swap" is not a class or function template name in the current scope
  RCPP_GENERATE_SWAP(generic_proxy,VECSXP)
  ^

In file included from ../inst/include/Rcpp/Vector.h(69),
                 from ../inst/include/Rcpp.h(38),
                 from Date.cpp(31):
../inst/include/Rcpp/vector/swap.h(36): error: "swap" is not a class or function template name in the current scope
  RCPP_GENERATE_SWAP(generic_proxy,EXPRSXP)
  ^

In file included from ../inst/include/Rcpp/Vector.h(69),
                 from ../inst/include/Rcpp.h(38),
                 from Date.cpp(31):
../inst/include/Rcpp/vector/swap.h(37): error: "swap" is not a class or function template name in the current scope
  RCPP_GENERATE_SWAP(string_proxy,STRSXP)
  ^

Date.cpp(562): warning #437: reference to local variable of enclosing function is not allowed
              2 * sizeof *sp + 4 * TZ_MAX_TIMES];
                          ^

compilation aborted for Date.cpp (code 2)
make: *** [Date.o] Error 2
ERROR: compilation failed for package ‘Rcpp’

>安装程序包（“Rcpp”）
strtime中的警告（xx，f这是我对正在发生的事情的最佳猜测。在
Rcpp
中，我们为
std:：swap（）
提供了专门化，并复制了相关位以简化说明：

namespace std {

#undef RCPP_GENERATE_SWAP
#define RCPP_GENERATE_SWAP(TYPE,RTYPE)                          \
    template<> inline void swap< Rcpp::internal::TYPE<RTYPE> >( \
        Rcpp::internal::TYPE<RTYPE>& a ,                            \
        Rcpp::internal::TYPE<RTYPE>& b) {                           \
            a.swap(b) ;                                             \
        }

RCPP_GENERATE_SWAP(generic_proxy,VECSXP)
RCPP_GENERATE_SWAP(generic_proxy,EXPRSXP)
RCPP_GENERATE_SWAP(string_proxy,STRSXP)
#undef RCPP_GENERATE_SWAP

}

名称空间std{
#未定义RCPP\u生成\u交换
#定义RCPP_生成_交换（类型，RTYPE）\
模板内联无效交换（\
Rcpp:：内部：：类型&a\
Rcpp:：internal:：TYPE&b）{\
a、 掉期（b）\
}
RCPP_生成_交换（通用_代理，VECSXP）
RCPP_生成_交换（通用_代理，EXPRSXP）
RCPP_生成_交换（字符串_代理，STRSXP）
#未定义RCPP\u生成\u交换
}

它看起来像是编译器遇到此头的时刻，即
std:：swap（）的适当模板定义
还没有被看到，因此它会呕吐。这对我来说似乎很奇怪，因为我们确实明确提供了一个
#include倡导者，在定义类型的命名空间中提供这些专门化，而不是
std
，以允许ADL

您可以尝试在本地修改Rcpp源，以查看是否可以提供支持
std:：swap（）
（如
cppreference
所建议的）的替代方法，然后建议对
Rcpp
进行上游修改，如果一切正常的话。
这可能是r-sig-mac邮件列表的一个问题…明白了！再次感谢这么一个可爱的包。是的。这些
swap
可能属于
Rcpp:：
谢谢！我实际上尝试过在linux集群上使用英特尔编译器安装RcppRcpp（以及RcppArmadillo）安装时毫无怨言。因此，我怀疑这是Mac OSX特有的功能，可能与英特尔编译器结合使用。我将按照建议进行操作，并报告。