Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/8/meteor/3.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
将数据导入R-参数为空_R_Import - Fatal编程技术网

将数据导入R-参数为空

将数据导入R-参数为空,r,import,R,Import,我尝试使用一个名为GOSemSim的R包,它需要将大量数据导入具有以下特定格式的变量: data1 = c("one", "two", "three") data2 = c("A", "B", "C") 当我尝试导入变量的数据列表长于293时,我会收到以下错误消息: argument 293 is empty “”或逗号并没有错误,我是用linux计算的,不管它是什么数据 基本上这真的很奇怪,我在两台电脑上试过,但运气都不好。我试图将其作为CSV文件导入,但R包不允许 有人知道为什么不能导入

我尝试使用一个名为GOSemSim的R包,它需要将大量数据导入具有以下特定格式的变量:

data1 = c("one", "two", "three")
data2 = c("A", "B", "C")
当我尝试导入变量的数据列表长于293时,我会收到以下错误消息:

argument 293 is empty
“”或逗号并没有错误,我是用linux计算的,不管它是什么数据

基本上这真的很奇怪,我在两台电脑上试过,但运气都不好。我试图将其作为CSV文件导入,但R包不允许

有人知道为什么不能导入超过293个数据吗

更新: 这是代码和我的数据,它是R中的一行代码,对我来说从来都不是问题

OQ = c("GO:0000003", "GO:0000070", "GO:0000077", "GO:0000079", "GO:0000082", "GO:0000086", "GO:0000122", "GO:0000212", "GO:0000226", "GO:0000278", "GO:0000279", "GO:0000280", "GO:0000724", "GO:0000725", "GO:0000819", "GO:0000910", "GO:0001932", "GO:0002118", "GO:0002121", "GO:0002165", "GO:0003002", "GO:0003006", "GO:0006022", "GO:0006030", "GO:0006040", "GO:0006139", "GO:0006259", "GO:0006260", "GO:0006261", "GO:0006267", "GO:0006270", "GO:0006275", "GO:0006277", "GO:0006281", "GO:0006302", "GO:0006304", "GO:0006305", "GO:0006306", "GO:0006310", "GO:0006323", "GO:0006325", "GO:0006342", "GO:0006351", "GO:0006355", "GO:0006357", "GO:0006366", "GO:0006464", "GO:0006468", "GO:0006479", "GO:0006725", "GO:0006807", "GO:0006928", "GO:0006950", "GO:0006974", "GO:0006996", "GO:0007010", "GO:0007017", "GO:0007018", "GO:0007049", "GO:0007051", "GO:0007059", "GO:0007062", "GO:0007067", "GO:0007076", "GO:0007088", "GO:0007093", "GO:0007095", "GO:0007098", "GO:0007126", "GO:0007127", "GO:0007131", "GO:0007140", "GO:0007141", "GO:0007143", "GO:0007154", "GO:0007155", "GO:0007156", "GO:0007259", "GO:0007266", "GO:0007275", "GO:0007276", "GO:0007281", "GO:0007282", "GO:0007292", "GO:0007304", "GO:0007307", "GO:0007346", "GO:0007350", "GO:0007365", "GO:0007367", "GO:0007379", "GO:0007389", "GO:0007399", "GO:0007400", "GO:0007417", "GO:0007420", "GO:0007423", "GO:0007444", "GO:0007472", "GO:0007476", "GO:0007552", "GO:0007560", "GO:0008104", "GO:0008213", "GO:0008283", "GO:0008284", "GO:0008315", "GO:0008356", "GO:0009059", "GO:0009611", "GO:0009653", "GO:0009790", "GO:0009791", "GO:0009880", "GO:0009886", "GO:0009887", "GO:0009888", "GO:0009889", "GO:0009890", "GO:0009892", "GO:0009893", "GO:0009896", "GO:0009968", "GO:0009987", "GO:0010032", "GO:0010033", "GO:0010092", "GO:0010389", "GO:0010468", "GO:0010498", "GO:0010556", "GO:0010558", "GO:0010564", "GO:0010604", "GO:0010605", "GO:0010608", "GO:0010629", "GO:0010648", "GO:0010948", "GO:0014016", "GO:0014017", "GO:0014070", "GO:0016043", "GO:0016055", "GO:0016070", "GO:0016310", "GO:0016319", "GO:0016321", "GO:0016441", "GO:0016458", "GO:0016568", "GO:0016569", "GO:0016570", "GO:0016571", "GO:0016572", "GO:0017145", "GO:0018130", "GO:0019219", "GO:0019222", "GO:0019438", "GO:0019827", "GO:0019953", "GO:0022402", "GO:0022403", "GO:0022404", "GO:0022412", "GO:0022414", "GO:0022610", "GO:0023052", "GO:0023057", "GO:0030111", "GO:0030154", "GO:0030178", "GO:0030182", "GO:0030261", "GO:0030422", "GO:0030703", "GO:0030727", "GO:0031023", "GO:0031047", "GO:0031050", "GO:0031056", "GO:0031060", "GO:0031123", "GO:0031145", "GO:0031175", "GO:0031323", "GO:0031324", "GO:0031325", "GO:0031326", "GO:0031327", "GO:0031331", "GO:0031398", "GO:0031399", "GO:0031401", "GO:0031570", "GO:0031572", "GO:0031935", "GO:0032268", "GO:0032270", "GO:0032501", "GO:0032502", "GO:0032504", "GO:0032507", "GO:0032774", "GO:0032776", "GO:0032886", "GO:0033043", "GO:0033044", "GO:0033260", "GO:0033301", "GO:0033554", "GO:0034622", "GO:0034641", "GO:0034645", "GO:0034654", "GO:0034754", "GO:0034968", "GO:0035023", "GO:0035107", "GO:0035114", "GO:0035120", "GO:0035186", "GO:0035194", "GO:0035195", "GO:0035220", "GO:0035282", "GO:0035295", "GO:0035825", "GO:0036211", "GO:0036388", "GO:0040029", "GO:0042060", "GO:0042221", "GO:0042445", "GO:0043009", "GO:0043066", "GO:0043069", "GO:0043161", "GO:0043170", "GO:0043331", "GO:0043412", "GO:0043414", "GO:0043549", "GO:0043631", "GO:0043933", "GO:0044237", "GO:0044249", "GO:0044260", "GO:0044271", "GO:0044419", "GO:0044700", "GO:0044702", "GO:0044703", "GO:0044707", "GO:0044728", "GO:0044763", "GO:0044767", "GO:0044770", "GO:0044771", "GO:0044772", "GO:0044773", "GO:0044774", "GO:0044786", "GO:0044818", "GO:0044839", "GO:0044843", "GO:0044848", "GO:0045132", "GO:0045165", "GO:0045168", "GO:0045185", "GO:0045448", "GO:0045455", "GO:0045787", "GO:0045814", "GO:0045859", "GO:0045892", "GO:0045931", "GO:0045934", "GO:0046331", "GO:0046425", "GO:0046483", "GO:0046580", "GO:0046605", "GO:0046777", "GO:0048070", "GO:0048134", "GO:0048135", "GO:0048285", "GO:0048311", "GO:0048468", "GO:0048477", "GO:0048513", "GO:0048518", "GO:0048519", "GO:0048522", "GO:0048523", "GO:0048563", "GO:0048569", "GO:0048583", "GO:0048585", "GO:0048609", "GO:0048646", "GO:0048666", "GO:0048699", "GO:0048704", "GO:0048705", "GO:0048706", "GO:0048707", "GO:0048731", "GO:0048736", "GO:0048737", "GO:0048754", "GO:0048856", "GO:0048863", "GO:0048865", "GO:0048867", "GO:0048869", "GO:0050789", "GO:0050793", "GO:0050794", "GO:0050896", "GO:0051052", "GO:0051058", "GO:0051128", "GO:0051171", "GO:0051172", "GO:0051225", "GO:0051235", "GO:0051246", "GO:0051247", "GO:0051252", "GO:0051253", "GO:0051276", "GO:0051297", "GO:0051299", "GO:0051301", "GO:0051302", "GO:0051321", "GO:0051325", "GO:0051329", "GO:0051338", "GO:0051351", "GO:0051443", "GO:0051445", "GO:0051641", "GO:0051646", "GO:0051651", "GO:0051704", "GO:0051716", "GO:0051726", "GO:0051783", "GO:0051785", "GO:0060255", "GO:0060429", "GO:0060548", "GO:0060688", "GO:0060966", "GO:0060968", "GO:0060993", "GO:0061138", "GO:0065003", "GO:0065004", "GO:0065007", "GO:0070192", "GO:0070507", "GO:0070887", "GO:0070918", "GO:0071103", "GO:0071359", "GO:0071822", "GO:0071824", "GO:0071840", "GO:0071897", "GO:0071900", "GO:0072028", "GO:0072078", "GO:0072079", "GO:0072088", "GO:0080090", "GO:0090068", "GO:0090304", "GO:0090306", "GO:0098609", "GO:1901071", "GO:1901360", "GO:1901362", "GO:1901576", "GO:1901987", "GO:1901988", "GO:1901990", "GO:1901991", "GO:1902275", "GO:1902299", "GO:1902589", "GO:1902679", "GO:1902749", "GO:1903046", "GO:1903047", "GO:1903308", "GO:1903322", "GO:2000026", "GO:2000112", "GO:2000113", "GO:2001141")

错误消息本身具有信息性。如果有人试图使其可复制,最好使用小子集。在试图重现行为之前,死死盯着数据看通常会有所帮助。比如说,

OQ = c("GO:0000003", "GO:2001141", )
请注意,此字符向量有两个元素。还是他们

Error in c("GO:0000003", "GO:2001141", ) : argument 3 is empty
3号是关键。R需要三个元素。注意第二个元素后面的逗号。一旦删除它,就可以创建
QQ
变量。浏览你的真实例子。我肯定某处有一个

编辑

我尝试将您的代码复制/粘贴到Rstudio中的脚本中,结果产生了您描述的错误。如果向右滚动,您会注意到语法着色在5000左右不起作用。我已经折叠了代码,这样它就可以放在屏幕上,并且运行良好

这就是我折叠向量的方法,它是这样工作的

OQ = c("GO:0000003", "GO:0000070", "GO:0000077", "GO:0000079", "GO:0000082", "GO:0000086", "GO:0000122",
       "GO:0000212", "GO:0000226", "GO:0000278", "GO:0000279", "GO:0000280", "GO:0000724", "GO:0000725", 
       "GO:0000819", "GO:0000910", "GO:0001932", "GO:0002118", "GO:0002121", "GO:0002165", "GO:0003002", 
       "GO:0003006", "GO:0006022", "GO:0006030", "GO:0006040", "GO:0006139", "GO:0006259", "GO:0006260", 
       "GO:0006261", "GO:0006267", "GO:0006270", "GO:0006275", "GO:0006277", "GO:0006281", "GO:0006302", 
       "GO:0006304", "GO:0006305", "GO:0006306", "GO:0006310", "GO:0006323", "GO:0006325", "GO:0006342", 
       "GO:0006351", "GO:0006355", "GO:0006357", "GO:0006366", "GO:0006464", "GO:0006468", "GO:0006479", 
       "GO:0006725", "GO:0006807", "GO:0006928", "GO:0006950", "GO:0006974", "GO:0006996", "GO:0007010", 
       "GO:0007017", "GO:0007018", "GO:0007049", "GO:0007051", "GO:0007059", "GO:0007062", "GO:0007067", 
       "GO:0007076", "GO:0007088", "GO:0007093", "GO:0007095", "GO:0007098", "GO:0007126", "GO:0007127", 
       "GO:0007131", "GO:0007140", "GO:0007141", "GO:0007143", "GO:0007154", "GO:0007155", "GO:0007156", 
       "GO:0007259", "GO:0007266", "GO:0007275", "GO:0007276", "GO:0007281", "GO:0007282", "GO:0007292", 
       "GO:0007304", "GO:0007307", "GO:0007346", "GO:0007350", "GO:0007365", "GO:0007367", "GO:0007379", 
       "GO:0007389", "GO:0007399", "GO:0007400", "GO:0007417", "GO:0007420", "GO:0007423", "GO:0007444", 
       "GO:0007472", "GO:0007476", "GO:0007552", "GO:0007560", "GO:0008104", "GO:0008213", "GO:0008283", 
       "GO:0008284", "GO:0008315", "GO:0008356", "GO:0009059", "GO:0009611", "GO:0009653", "GO:0009790", 
       "GO:0009791", "GO:0009880", "GO:0009886", "GO:0009887", "GO:0009888", "GO:0009889", "GO:0009890", 
       "GO:0009892", "GO:0009893", "GO:0009896", "GO:0009968", "GO:0009987", "GO:0010032", "GO:0010033", 
       "GO:0010092", "GO:0010389", "GO:0010468", "GO:0010498", "GO:0010556", "GO:0010558", "GO:0010564", 
       "GO:0010604", "GO:0010605", "GO:0010608", "GO:0010629", "GO:0010648", "GO:0010948", "GO:0014016", 
       "GO:0014017", "GO:0014070", "GO:0016043", "GO:0016055", "GO:0016070", "GO:0016310", "GO:0016319", 
       "GO:0016321", "GO:0016441", "GO:0016458", "GO:0016568", "GO:0016569", "GO:0016570", "GO:0016571", 
       "GO:0016572", "GO:0017145", "GO:0018130", "GO:0019219", "GO:0019222", "GO:0019438", "GO:0019827", 
       "GO:0019953", "GO:0022402", "GO:0022403", "GO:0022404", "GO:0022412", "GO:0022414", "GO:0022610", 
       "GO:0023052", "GO:0023057", "GO:0030111", "GO:0030154", "GO:0030178", "GO:0030182", "GO:0030261", 
       "GO:0030422", "GO:0030703", "GO:0030727", "GO:0031023", "GO:0031047", "GO:0031050", "GO:0031056", 
       "GO:0031060", "GO:0031123", "GO:0031145", "GO:0031175", "GO:0031323", "GO:0031324", "GO:0031325", 
       "GO:0031326", "GO:0031327", "GO:0031331", "GO:0031398", "GO:0031399", "GO:0031401", "GO:0031570", 
       "GO:0031572", "GO:0031935", "GO:0032268", "GO:0032270", "GO:0032501", "GO:0032502", "GO:0032504", 
       "GO:0032507", "GO:0032774", "GO:0032776", "GO:0032886", "GO:0033043", "GO:0033044", "GO:0033260", 
       "GO:0033301", "GO:0033554", "GO:0034622", "GO:0034641", "GO:0034645", "GO:0034654", "GO:0034754", 
       "GO:0034968", "GO:0035023", "GO:0035107", "GO:0035114", "GO:0035120", "GO:0035186", "GO:0035194", 
       "GO:0035195", "GO:0035220", "GO:0035282", "GO:0035295", "GO:0035825", "GO:0036211", "GO:0036388", 
       "GO:0040029", "GO:0042060", "GO:0042221", "GO:0042445", "GO:0043009", "GO:0043066", "GO:0043069", 
       "GO:0043161", "GO:0043170", "GO:0043331", "GO:0043412", "GO:0043414", "GO:0043549", "GO:0043631", 
       "GO:0043933", "GO:0044237", "GO:0044249", "GO:0044260", "GO:0044271", "GO:0044419", "GO:0044700", 
       "GO:0044702", "GO:0044703", "GO:0044707", "GO:0044728", "GO:0044763", "GO:0044767", "GO:0044770", 
       "GO:0044771", "GO:0044772", "GO:0044773", "GO:0044774", "GO:0044786", "GO:0044818", "GO:0044839", 
       "GO:0044843", "GO:0044848", "GO:0045132", "GO:0045165", "GO:0045168", "GO:0045185", "GO:0045448", 
       "GO:0045455", "GO:0045787", "GO:0045814", "GO:0045859", "GO:0045892", "GO:0045931", "GO:0045934", 
       "GO:0046331", "GO:0046425", "GO:0046483", "GO:0046580", "GO:0046605", "GO:0046777", "GO:0048070", 
       "GO:0048134", "GO:0048135", "GO:0048285", "GO:0048311", "GO:0048468", "GO:0048477", "GO:0048513", 
       "GO:0048518", "GO:0048519", "GO:0048522", "GO:0048523", "GO:0048563", "GO:0048569", "GO:0048583", 
       "GO:0048585", "GO:0048609", "GO:0048646", "GO:0048666", "GO:0048699", "GO:0048704", "GO:0048705", 
       "GO:0048706", "GO:0048707", "GO:0048731", "GO:0048736", "GO:0048737", "GO:0048754", "GO:0048856", 
       "GO:0048863", "GO:0048865", "GO:0048867", "GO:0048869", "GO:0050789", "GO:0050793", "GO:0050794", 
       "GO:0050896", "GO:0051052", "GO:0051058", "GO:0051128", "GO:0051171", "GO:0051172", "GO:0051225", 
       "GO:0051235", "GO:0051246", "GO:0051247", "GO:0051252", "GO:0051253", "GO:0051276", "GO:0051297", 
       "GO:0051299", "GO:0051301", "GO:0051302", "GO:0051321", "GO:0051325", "GO:0051329", "GO:0051338", 
       "GO:0051351", "GO:0051443", "GO:0051445", "GO:0051641", "GO:0051646", "GO:0051651", "GO:0051704", 
       "GO:0051716", "GO:0051726", "GO:0051783", "GO:0051785", "GO:0060255", "GO:0060429", "GO:0060548", 
       "GO:0060688", "GO:0060966", "GO:0060968", "GO:0060993", "GO:0061138", "GO:0065003", "GO:0065004", 
       "GO:0065007", "GO:0070192", "GO:0070507", "GO:0070887", "GO:0070918", "GO:0071103", "GO:0071359", 
       "GO:0071822", "GO:0071824", "GO:0071840", "GO:0071897", "GO:0071900", "GO:0072028", "GO:0072078", 
       "GO:0072079", "GO:0072088", "GO:0080090", "GO:0090068", "GO:0090304", "GO:0090306", "GO:0098609", 
       "GO:1901071", "GO:1901360", "GO:1901362", "GO:1901576", "GO:1901987", "GO:1901988", "GO:1901990", 
       "GO:1901991", "GO:1902275", "GO:1902299", "GO:1902589", "GO:1902679", "GO:1902749", "GO:1903046", 
       "GO:1903047", "GO:1903308", "GO:1903322", "GO:2000026", "GO:2000112", "GO:2000113", "GO:2001141")

我认为,从你迄今为止向我们提供的大量信息来看,你的问题是无法诊断的。你要导入的文件是什么(让我们看一个例子),你要用什么代码导入它?我做了,我甚至没有导入文件,只是将原始数据导入变量!一旦我删除
{SOME MORE DATA}
,我就能够生成QQ变量。请确保您的问题是可复制的。是的,对不起,我可能不清楚,我不想用一个巨大的列表垃圾邮件的一切,但我只是粘贴了我的巨大列表无论如何!!我明白,但我很确定任何地方都没有多余的逗号,首先我检查了(手动和自动地用换行符替换逗号,没有发现任何问题),然后我用linux创建了这个数据列表,它不会在任何地方省略一个逗号,这真是奇怪@用户3188922,你给出的代码行不会在我的计算机上引发任何错误真的@CathG?但是它是否将整个数据列表导入变量OQ?@user3188922,它给了我一个406项向量(第293个being“GO:0048477”)。我没有用RStudioOk,那么也许smtg错了,我的R,但我在两台电脑上试过!废话!!我不知道该怎么解决这个问题,谢谢!