Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/r/70.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
R 基因绘图仪安装错误_R_Namespaces_Bioconductor - Fatal编程技术网

R 基因绘图仪安装错误

R 基因绘图仪安装错误,r,namespaces,bioconductor,R,Namespaces,Bioconductor,我在geneplotter(Bioconductor package)安装过程中遇到了一些问题。我在LinuxMint9上使用R2.14。我认为名称空间对此负责,但我不知道如何修复它 以下是错误: > source("http://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite("geneplotter") BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org' Using R version 2.14, BiocIns

我在geneplotter(Bioconductor package)安装过程中遇到了一些问题。我在LinuxMint9上使用R2.14。我认为名称空间对此负责,但我不知道如何修复它

以下是错误:

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("geneplotter")
BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org'
Using R version 2.14, BiocInstaller version 1.2.0.
Installing package(s) 'geneplotter'
Installing package(s) into ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14’
(as ‘lib’ is unspecified)
essai de l'URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.9/bioc/src/contrib/geneplotter_1.31.4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1387616 bytes (1.3 Mb)
URL ouverte
==================================================
downloaded 1.3 Mb

* installing *source* package ‘geneplotter’ ...
** R
** data
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices ...
*** tangling vignette sources ...
   ‘byChroms.Rnw’ 
   ‘visualize.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded
Error in namespaceExport(ns, exports) : 
  undefined exports: .__C__file, .__C__connection
Erreur : le chargement a échoué
Exécution arrêtée
ERREUR : le chargement a échoué
* removing ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/geneplotter’

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpO1aY1T/downloaded_packages’
Message d'avis :
In install.packages(pkgs = pkgs, repos = repos, ...) :
  installation of package ‘geneplotter’ had non-zero exit status
提前感谢,


N.

更详细地了解这一点,
geneplotter
首次发布。因此,您选择的版本是倒数第二个版本。您发现的问题已在昨天得到纠正,及时用于下一个构建周期<代码>基因绘图仪应在正确构建时正确安装,可能在中午PDT时安装;查找版本1.32.1。回想起来,这不是一个很好的问题;Bioconductor有一个不需要订阅的软件包。

请联系软件包维护人员???在2.14中,名称空间处理发生了变化,很可能一些Bioconductor软件包没有跟上……更新新版本的所有软件包,特别是rtracklayer;尝试
biocLite(character())
I更新了所有软件包,但错误仍然存在。